ABO式血液型遺伝子転写調節機構解明と法医学および医療への応用

2018 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17H05079
• Research Institution: Gunma University
• Principal Investigator: 佐野 利恵 群馬大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (70455955)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: ＡＢＯ遺伝子

Outline of Annual Research Achievements

真核生物のゲノムには、トポロジカル関連ドメイン(TAD)と呼ばれる三次元構造が存在し、このドメイン内では配列上離れたプロモーターやエンハンサーであっても、近接して相互作用し、遺伝子発現が制御されることや、TADの境界にCCCTC結合因子(CTCF)が結合することが報告されている。
また、トポロジカル関連ドメインと関係して、一つの転写活性化領域（エンハンサー）を複数の遺伝子が共有して共同して転写調節がなされることが知られてきた。ＡＢＯ遺伝子のエンハンサーにおいても同様の機序が存在すると考えられたことから、エンハンサー欠失細胞を作製し、ＡＢＯ周辺の遺伝子の発現変化について調べてみることとした。その結果、隣接する遺伝子以外にもやや遠くの遺伝子座においても遺伝子発現の変化が見られるものがあった。これはゲノムアノテーションデータによるＧＥＮＥＨＡＮＣＥＲが示すデータに矛盾しないものであった。
これらの実験結果から考察すると、一つの小さなＴＡＤ内における転写調節だけでなく、複数のＴＡＤが近接して転写調節を受けたり、小さなＴＡＤを内包する、より大きなＴＡＤによる転写調節が関与している可能性が考えられることから、より詳細な検討を通して、ＡＢＯ遺伝子と周囲の遺伝子の転写調節機構について明らかにしていく。関係する遺伝子座には、生理活性と関係する遺伝子も含まれていることから、血液型との関係についても調べていく。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ＡＢＯ遺伝子エンハンサー欠失細胞は作製でき、遺伝子発現変化を調べることができた。
また、新しいゲノムアノテーションデータが参照できることから、比較検討が容易に進んだ。

Strategy for Future Research Activity

ＡＢＯエンハンサーを共有する他の遺伝子についてより詳細な検討を加え、血液型との関係について検討する。

Research Products

• [Journal Article] Usefulness of coronary postmortem computed tomography angiography to detect lesions in the coronary artery and myocardium in cases of sudden death. (2018)
  • Author(s): Takei H, Sano R, Takahashi Y, Takahashi K, Kominato Y, Tokue H, Shimada T, Awata S, Hirasawa S, Ohta N.
  • Journal Title: Leg Med. Volume: 30 Pages: 46-51
  • DOI: 10.1016/j.legalmed.2017.11.005
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Use of postmortem computed tomography to retrieve small metal fragments derived from a weapon in the bodies of victims in two homicide cases. (2018)
  • Author(s): Sano R, Takahashi Y, Hayakawa A, Murayama M, Kubo R, Hirasawa S, Tokue H, Shimada T, Awata S, Takei H, Yuasa M, Uetake S, Akuzawa H, Kominato Y.
  • Journal Title: Leg Med. Volume: 32 Pages: 87-89
  • DOI: 10.1016/j.legalmed.2018.03.006
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Tattoo image composed of radiopaque deposits demonstrated by postmortem computed tomography. (2018)
  • Author(s): Hayakawa A, Sano R, Takei H, Takahashi Y, Kubo R, Tokue H, Hirasawa S, Shimada T, Awata S, Yuasa M, Uetake S, Akuzawa H, Kominato Y, Tattoo image composed of radiopaque deposits demonstrated by postmortem computed tomography.
  • Journal Title: Leg Med. Volume: 35 Pages: 9-11
  • DOI: 10.1016/j.legalmed.2018.09.002
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Interleukin 8-251 A>T polymorphism(rs4073) in Japanese subpopulations and its correlation with smoking rates. (2018)
  • Author(s): Kaori Kimura-Kataoka, Misuzu Ueki, Toshihiro Yasuda, Reiko Iida, Junko Fujihara, Kazuo Yamada, Rie Sano, Yoshihiko Kominato, Haruo Takeshita.
  • Organizer: 24th Congress of the International Academy of Legal Medicine(IALM).
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Reduction of CTCF binding to the ABO promoter by nucleotide substitutions found in individuals with phenotypes A3 and B3. (2018)
  • Author(s): Rie Sano, Rieko Kubo, Yoichiro Takahashi, Haruo Takeshita, Yoshihiko Kominato.
  • Organizer: 24th Congress of the International Academy of Legal Medicine(IALM).
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Usefulness of coronary postmortem computed tomography angiography to detect lesions in the coronary artery and myocardium in cases of sudden death.. (2018)
  • Author(s): Rie Sano, Yoichiro Takahashi, Kaori Kimura-Kataoka, Haruo Takeshita, Yoshihiko Kominato.
  • Organizer: 24th Congress of the International Academy of Legal Medicine(IALM).
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] A3, B3型におけるABO遺伝子プロモーターの一塩基置換はCTCFの結合を減弱させる. (2018)
  • Author(s): 佐野利恵, 高橋遥一郎, 伊佐和美, 常山初江, 小笠原健一, 横濱章彦, 小湊慶彦
  • Organizer: 第66回日本輸血・細胞治療学会総会．
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] A3, B3型におけるABO遺伝子プロモーターの一塩基置換はCTCFの結合を減弱させる. (2018)
  • Author(s): 佐野利恵, 高橋遥一郎, 窪理英子, 早川輝, 藤原純子, 竹下治男, 小湊慶彦.
  • Organizer: 日本DNA多型学会第27回学術集会
  • Int'l Joint Research