• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanisms for centromere formation

Research Project

Project/Area Number 17H06167
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

深川 竜郎  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (60321600)

Project Period (FY) 2017-05-31 – 2022-03-31
Keywordsセントロメア / キネトコア / 細胞周期 / エピジェネティックス / 電子顕微鏡 / 構造解析 / ゲノム科学
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、セントロメアの形成機構の理解を目標に以下の3計画の研究を行い成果をあげた。
I) 細胞周期に依存したセントロメア構成タンパク質ネットワークの理解: CENP-Cのリン酸化がCENP-Aの結合に重要であることを見出し、ゲノム編集によりリン酸化を受けないCENP-Cが発現する細胞を作成して、その表現型の解析を行った。この細胞自体は、染色体分配に異常がなかったが、原因はCENP-Tによる機能相補と考え、CENP-Tの経路を破壊した状態でCENP-Cのリン酸化サイトに変異を加えた細胞も作成し、この状態ではCENP-Cリン酸化が必須であることが証明できた。また、ヒト細胞でも同様の実験を行い、CENP-Cのリン酸化がM期のセントロメア局在に必須であることも示せた。今後は、この分子基盤を解析する。
II) セントロメアが形成されるゲノム基盤の理解: セントロメアクロマチンの確立に重要なCENP-Aのセントロメアへの導入機構を明らかにするために、CENP-AのシャペロンであるHJURPとの関係を解析し、これまでに報告されていない結合モードを見出した。また、セントロメアクロマチンについて、4C-seqやHi-Cを用たデータを蓄積した。
III) 電子顕微鏡を活用したセントロメアタンパク質複合体の構造基盤の理解: クライオ電子顕微鏡を活用してCENP-AヌクレオソームとCENP-Cの高精度の構造解析には成功し、CENP-A の結合に関わる新しいドメインを発見した。また、CENP-Cのドメイン構造についてX線結晶構造解析を併用しながら、構造解析を行い、C末端側のユニークな構造を見出した。また、CENP-H複合体の構造解析にも着手した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

細胞周期に依存したセントロメア構成タンパク質ネットワークの変化に関しては、順調に研究が進み、CENP-Cのリン酸化制御という新しい概念を発表し、論文として発表した。分野の内外から注目を受け、予定以上に研究は進んでいる。また、セントロメゲノムの解析についても、独自の研究系を有していることもあり、世界に先駆けて研究が進み、CENP-Aがどのようにセントロメアへ取り込まれるのかという点で新しい発見が見出された。再構成実験やクライオ電子顕微鏡を用いた構造解析の実験についても、CENP-AヌクレオソームとCENP-Cの高精度の構造がクライオ電子顕微鏡で明らかにできた。また、CENP-Nを含めた構造も明らかになり、当初の計画以上のペースで研究は、進展している。

Strategy for Future Research Activity

基本的に計画に沿って研究を進める。予定以上に計画が順調に進んでいるので、さらに研究を発展できる内容を盛り込む。

  • Research Products

    (39 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (14 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Peer Reviewed: 14 results,  Open Access: 10 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 9 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] エジンバラ大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      エジンバラ大学
  • [Int'l Joint Research] キューリ研究所(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      キューリ研究所
  • [Int'l Joint Research] MIT(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      MIT
  • [Int'l Joint Research] JNCASR(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      JNCASR
  • [Journal Article] Bridgin connects the outer kinetochore to centromeric chromatin.2021

    • Author(s)
      Sridhar S, Hori T, Nakagawa R, Fukagawa T, Sanyal K.
    • Journal Title

      Nat Commun.

      Volume: 12 Pages: 146

    • DOI

      10.1038/s41467-020-20161-9.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome in complex with phosphorylated CENP-C.2021

    • Author(s)
      Ariyoshi M, Makino F, Watanabe R, Nakagawa R, Kato T, Namba K, Arimura Y, Fujita R, Kurumizaka H, Okumura EI, Hara M, Fukagawa T.
    • Journal Title

      EMBO J.

      Volume: 40 Pages: e105671.

    • DOI

      10.15252/embj.2020105671.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Kinetochore stretching-mediated rapid silencing of the spindle-assembly checkpoint required for failsafe chromosome segregation.2021

    • Author(s)
      Uchida KSK, Jo M, Nagasaka K, Takahashi M, Shindo N, Shibata K, Tanaka K, Masumoto H, Fukagawa T, Hirota T.
    • Journal Title

      Curr. Biol.

      Volume: online Pages: S0960-9822

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.01.062.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CENP-C Phosphorylation by CDK1 in vitro.2021

    • Author(s)
      Watanabe R, Hara M, Ariyoshi M, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Bio Protoc.

      Volume: 11 Pages: e3879.

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.3879.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cryo-EM Structures of Centromeric Tri-nucleosomes Containing a Central CENP-A Nucleosome.2020

    • Author(s)
      Yoshimasa Takizawa, Cheng-Han Ho, Hiroaki Tachiwana, Hideyuki Matsunami, Wataru Kobayashi, Midori Suzuki, Yasuhiro Arimura, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Melanie D. Ohi, Matthias Wolf, Hitoshi Kurumizaka
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 28 Pages: 44-53

    • DOI

      10.1016/j.str.2019.10.016.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Artificial generation of centromeres and kinetochores to understand their structure and function.2020

    • Author(s)
      Hori T, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Exp Cell Res.

      Volume: 380 Pages: 111898

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2020.111898.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dynamics of kinetochore structure and its regulations during mitotic progression.2020

    • Author(s)
      Hara M, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Cell Mol Life Sci.

      Volume: 77 Pages: 2981-2995.

    • DOI

      10.1007/s00018-020-03472-4.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CENP-50 is required for papilloma development in the two-stage skin carcinogenesis model.2020

    • Author(s)
      Saito M, Kagawa N, Okumura K, Munakata H, Isogai E, Fukagawa T, Wakabayashi Y.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: 111 Pages: 2850-2860

    • DOI

      10.1111/cas.14533.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] H3K9me3 maintenance on a human artificial chromosome is required for segregation but not centromere epigenetic memory.2020

    • Author(s)
      Martins NMC, Cisneros-Soberanis F, Pesenti E, Kochanova NY, Shang WH, Hori T, Nagase T, Kimura H, Larionov V, Masumoto H, Fukagawa T, Earnshaw WC.
    • Journal Title

      J Cell Sci.

      Volume: 133 Pages: jcs242610.

    • DOI

      10.1242/jcs.242610.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A super-sensitive auxin-inducible degron system with an engineered auxin-TIR1 pair.2020

    • Author(s)
      Nishimura K, Yamada R, Hagihara S, Iwasaki R, Uchida N, Kamura T, Takahashi K, Torii KU, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 48 Pages: e108

    • DOI

      10.1093/nar/gkaa748.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Essentiality of CENP-A Depends on Its Binding Mode to HJURP.2020

    • Author(s)
      Hori T, Cao J, Nishimura K, Ariyoshi M, Arimura Y, Kurumizaka H, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Cell Rep.

      Volume: 33 Pages: 108388

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.108388.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Where is the right path heading from the centromere to spindle microtubules?2019

    • Author(s)
      Masatoshi Hara, Tatsuo Fukagawa
    • Journal Title

      Cell Cycle

      Volume: 18 Pages: 1199-1211

    • DOI

      10.1080/15384101.2019.1617008.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Centromere maintenance during DNA replication.2019

    • Author(s)
      Masatoshi Hara, Tatsuo Fukagawa
    • Journal Title

      Nature Cell Biology

      Volume: 21 Pages: 669-671

    • DOI

      10.1038/s41556-019-0335-0.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CDK1-mediated CENP-C phosphorylation modulates CENP-A binding and mitotic kinetochore localization.2019

    • Author(s)
      Reito Watanabe, Masatoshi Hara, Ei-ichi Okumura, Solene Herve, Daniele Fachinetti, Mariko Ariyoshi, Tatsuo Fukagawa
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology

      Volume: 218 Pages: 4042-4062

    • DOI

      10.1083/jcb.201907006.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 染色体不安定およびゲノム再編成を防ぐ正確な動原体構造2020

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Dynamics on kinetochore assembly during cell cycle progression2020

    • Author(s)
      Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      GRC on centromere Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] セントロメアおよび動原体の分子基盤の解明2020

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      第92回日本遺伝学会大会
    • Invited
  • [Presentation] CENP-Aヌクレオソーム-CENP-Cタンパク質複合体の立体構造からみえてきた染色体分配を支えるキネトコア複合体の動的制御2020

    • Author(s)
      有吉眞理子、深川竜郎
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] CENP-C creates a compact chromatin configuration within centromeres2020

    • Author(s)
      原 昌稔、有吉 眞理子、深川 竜郎
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] キネトコアタンパク質結合ネットワークにおけるCENP-Cの役割2019

    • Author(s)
      原昌稔、深川竜郎
    • Organizer
      第37回染色体ワークショップ
  • [Presentation] CCAN-セントロメア結合の細胞周期依存的な制御とその役割2019

    • Author(s)
      渡邉励人、深川竜郎
    • Organizer
      第37回染色体ワークショップ
  • [Presentation] CDK1 Regulates CENP-A-CENP-C Interaction In Vertebrate Kinetochore.2019

    • Author(s)
      Masatoshi Hara, Reito Watanabe, Mariko Ariyoshi, and Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      ASCB/EMBO 2019 Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Essentiality of CENP-A Depends on Its Binding Mode to HJURP.2019

    • Author(s)
      Tetsuya Hori, JingHui Cao, Yasuhiro Arimura, Kohei Nishimura, Mariko Ariyoshi, Hitoshi Kurumizaka, and Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      ASCB/EMBO 2019 Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Kinetochore Dynamics During Progression of Cell Cycle.2019

    • Author(s)
      Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Essentiality of CENP-A depends on its binding mode to HJURP.2019

    • Author(s)
      堀哲也、曹静暉、有村泰宏、西村浩平、有吉眞理子、豊田敦、三須定彦、池尾一穂、胡桃坂仁志、深川竜郎
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Structural and functional analysis of a C-terminal region of a centromeric protein, CENP-C.2019

    • Author(s)
      有吉眞理子、佐野智基、原昌稔、深川竜郎
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Interaction mode between CENP-A and HJURP in vitro.2019

    • Author(s)
      曹静暉、有村泰宏、有吉眞理子、胡桃坂仁志、堀哲也、深川竜郎
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 染色体分配におけるKMNネットワークの役割2019

    • Author(s)
      竹之下憂祐、原昌稔、深川竜郎
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 細胞周期の進行に伴うCENP-Cのセントロメアクロマチンへの結合機構の変化とその意義2019

    • Author(s)
      渡邉励人、原昌稔、有吉眞理子、深川竜郎
    • Organizer
      第91回日本遺伝学会大会
  • [Presentation] 脊椎動物細胞におけるセントロメアの3次元構造解析2019

    • Author(s)
      西村浩平、堀哲也、豊田敦、古宮正隆、伊藤武彦、深川竜郎
    • Organizer
      第91回日本遺伝学会大会
  • [Presentation] 細胞周期進行にともなうセントロメアタンパク質結合ネットワークの変換2019

    • Author(s)
      原 昌稔、深川竜郎
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 染色体分配を司るセントロメア・キネトコアのダイナミクス2019

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      第38回分子病理研究会淡路シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 動的なキネトコア構造の実体2019

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
    • Invited
  • [Remarks] 深川研究室

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/fukagawa/index_j.html

  • [Remarks] 細胞分裂時に染色体の分配を制御する鍵となるしくみを解明

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/events/achievement/fukagawa-20191101/

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi