The mechanism of the binding of the bacterial condensin MukBEF to the chromospomal DNA

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17H07328
• Research Category: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Molecular biology
• Research Institution: National Institute of Genetics
• Principal Investigator: Akiyama Koichiro 国立遺伝学研究所, 遺伝形質研究系, 博士研究員 (10800675)
• Project Period (FY): 2017-08-25 – 2019-03-31
• Keywords: バクテリアコンデンシン / 染色体 / MukBEF

Outline of Final Research Achievements

I studied the mechanism of DNA binding of MukB, the E. coli condensin. I made 22 kinds of mutant forms of MukB. In vivo and in vitro experiments by using these MukB mutants revealed the residues important for the DNA binding. These residues are align on the line in the MukB crystal structure previously reported. Based on these results, I propose a novel DNA binding model of MukB.

Free Research Field

分子生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

コンデンシンタンパク質は大腸菌からヒトまで広く存在する。コンデンシンは一般に一本鎖DNAと二本鎖DNAのいずれにも結合するが、一本鎖DNAへの結合能をどの様に利用しているかに関しては不明点が多い。本研究ではMukBの一本鎖DNA結合に着目することでDNAへの結合の分子機構について新たな機能モデルを示した。この成果は大腸菌にとどまらず、コンデンシンの普遍的な機能の理解に貢献するものである。