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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Metabolic control via protein acylation in Thermus thermophilus

Research Project

Project/Area Number 17J40083
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

吉田 彩子  東京大学, 生物生産工学研究センター, 特別研究員(RPD) (90633686)

Project Period (FY) 2017-04-26 – 2020-03-31
Keywordsタンパク質アシル化修飾 / ロイシン生合成 / CoA体代謝 / Thermus thermophilus / 短鎖脂肪酸 / NAD+/NADH比
Outline of Annual Research Achievements

①タンパク質アシル化修飾によるロイシン生合成酵素の調節機構
網羅的解析から、高度好熱菌Thermus thermophilusのロイシン生合成酵素IPMDHがその活性発現に重要なリジン残基がスクシニル化修飾を受けることがわかっている。スクシニル化によるIPMDHの活性調節機構についても解析を進めたが、スクシニルCoAによって非酵素的にスクシニル化したIPMDHに活性の低下(変化)がみられなかった。また脱スクシニル化酵素の同定はできたが、脱スクシニル化酵素を欠いた株から調製したIPMDHの活性にも変化が見られず、IPMDHが細胞内でスクシニル化修飾される生理的意義は解明されていない。
②CoA体代謝関連酵素の調節機構
タンパク質アセチル化修飾とNAD+結合タンパク質との相互作用によって活性調節を受けるT. thermophilus由来のCoA transferase(CoAT)について、その活性調節機構の詳細を明らかにするため結晶構造解析を進め、CoATや相互作用タンパク質それぞれの結晶構造の決定に成功した。また、CoATとNAD+結合タンパク質の複合体がNAD+だけでなくNADHも結合し、それぞれに対する親和性が異なることから、細胞内のNAD+/NADH比を感知し、CoAT活性を調節していることを明らかにした。この調節機構が脂肪酸分解経路であるβ酸化への短鎖アシルCoAの供給量を制御し、アシルCoAやNADH生産を通じたエネルギー代謝調節に関わることを提唱した。
さらに、短鎖アシルCoA代謝に関わるアシルCoA合成酵素(ACS)ホモログについても機能構造解析を進め、4つあるACSホモログのうち1つはACS活性を示さないにもかかわらず、ある生育環境では生育に必須なことを破壊株、および相補株の解析から示した。また、本ACSホモログについても結晶構造解析を進め、部分構造の決定に成功した。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Biochemical characterization of archaeal homocitrate synthase from Sulfolobus?acidocaldarius2019

    • Author(s)
      Suzuki Tomohiro、Akiyama Nagisa、Yoshida Ayako、Tomita Takeo、Lassak Kerstin、Haurat Maria Florencia、Okada Takuya、Takahashi Kento、Albers Sonja‐Verena、Kuzuyama Tomohisa、Nishiyama Makoto
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 594 Pages: 126~134

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13550

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Glutamate Dehydrogenase from Thermus thermophilus Is Activated by AMP and Leucine as a Complex with Catalytically Inactive Adenine Phosphoribosyltransferase Homolog2019

    • Author(s)
      Tomita Takeo、Matsushita Hajime、Yoshida Ayako、Kosono Saori、Yoshida Minoru、Kuzuyama Tomohisa、Nishiyama Makoto
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 201 Pages: e00710-18

    • DOI

      10.1128/JB.00710-18

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 高度好熱菌由来CoA transferaseの制御タンパク質ADLPの機能構造解析2020

    • Author(s)
      吉田彩子、山本寛之、富田武郎、葛山智久、西山真
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会(学会中止)
  • [Presentation] アミノ基キャリアタンパク質を利用した一次・二次代謝生合成2019

    • Author(s)
      吉田彩子、西山真
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Regulatory function of CoA transferase from Thermus thermophilus HB272019

    • Author(s)
      Ayako Yoshida, Hiroyuki Yamamoto, Takeo Tomita, Minoru Yoshida, Saori Kosono, Tomohisa Kuzuyama, Makoto Nishiyama
    • Organizer
      Thermophiles 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 高度好熱菌由来短鎖脂肪酸代謝酵素の調節機構2019

    • Author(s)
      吉田彩子
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部 2019 年度大会
    • Invited
  • [Presentation] CoA transferase from Thermus thermophilus is regulated by catalytically inactive alanine dehydrogenase-like protein2019

    • Author(s)
      Ayako Yoshida, Hiroyuki Yamamoto, Takeo Tomita, Minoru Yoshida, Saori Kosono, Tomohisa Kuzuyama, Makoto Nishiyama
    • Organizer
      1st Japan-Germany-Switzerland Workshop for Enzyme Technology and Bioprocess Development 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] アミノ酸生合成酵素の機能と調節機構に関する研究2019

    • Author(s)
      吉田彩子
    • Organizer
      第18回日本農学進歩賞受賞講演
  • [Remarks] 東京大学生物生産工学研究センター細胞機能工学研究室ホームページ

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/biotec-res-ctr/saiboukinou/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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