2017 Fiscal Year Research-status Report
子ども期放射線被ばくによる発がんメカニズム~遺伝子ネットワークの解明
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17K01939
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Research Institution | National Institutes for Quantum and Radiological Science and Technology |
Principal Investigator |
石川 敦子 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 放射線医学総合研究所 放射線影響研究部, 主任技術員(任常) (30443063)
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Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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Keywords | 放射線 / 発がん / 遺伝子変異 / 子ども |
Outline of Annual Research Achievements |
こどもは大人に比べて放射線に対する発がん感受性が高いと考えられている。 これまでに異なる週齢で放射線を照射したマウスに誘発された胸腺リンパ腫の解析から、原因となる一部の遺伝子では、被ばく時の年齢によって変異パターンが異なることを報告した。本研究では、放射線照射後に発症した胸腺リンパ腫の次世代シークエンサーを用いたエクソーム解析及びDNAメチル化解析を行うことで、被ばく時年齢に依存した遺伝子変異パターンの全容と発がんのメカニズムを明らかにする。 本年度は、胸腺リンパ腫の腫瘍の次世代シークエンスデータの取得およびゲノム変異解析を行った。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
H29年度の研究計画では、胸腺リンパ腫の腫瘍の次世代シークエンスデータの取得およびゲノム変異解析を行った。次世代シークエンスデータの取得については、解析に必要なデータ数のおよそ半数のデータを取得した。ゲノム変異解析については、取得した次世代シークエンスデータを用いて、解析プログラムに必要なリファレンスゲノム情報を取得するとともに、解析条件の検討を行った。それぞれの解析プログラム(遺伝子変異:VarScan2、コピー数変異:FREEC)においてSNV/InDelとコピー数変異の解析条件を決定した。
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Strategy for Future Research Activity |
H29年度に引き続き、解析に用いる胸腺リンパ腫のサンプル調整および次世代シークエンス解析を進める。解析に必要なデータ数が揃い次第、被ばく時年齢が異なる腫瘍に特徴的なゲノム変異について網羅的な解析を行い、関連する遺伝子およびゲノム変異を同定する。
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Causes of Carryover |
実験の進み具合や試薬の使用期限を考慮に入れて、無駄のないよう効率的に使用する予定である。
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Research Products
(1 results)