2018 Fiscal Year Research-status Report
担がん患者における血漿遊離DNAの特性についての基礎的検討
| Project/Area Number |
17K07197
|
|---|
| Research Institution | Saga University |
|---|
Principal Investigator |
荒金 尚子 佐賀大学, 医学部, 准教授 (20321846)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 明美 佐賀大学, 医学部, 助教 (20568357)
中村 朝美 佐賀大学, 医学部, 助教 (90457490)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
|
| Keywords | circulating tumor DNA / EGFR / extracellular vesicle |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
１．担がん患者ctDNAで認めた二峰性ピークの臨床的意義: 前年度までで、肺がん患者ctDNAは、long fragment（5 Kb）、short fragment（170 bp）の二峰性ピークが見られた事、遠隔転移を有する症例で優位にlung fragmentの量が多かった事を示した。Long fragmentの存在機序について、DNase1、DNase1L3の量とlong fragment の相関について検討したが、相関は見られなかった。そのため、long fragmentの保護機構が働いていると考え以下の検討を行っている。
２．2峰性ピークの各DNAの塩基配列、会合分子の同定: long fragment、short fragmentのDNAを各々抽出し、次世代シークエンス解析の外注解析を行った。進行肺がん患者と共にコントロールとして健常人血漿遊離DNAも同時に検査に供した。その結果、分子Aが候補として同定された。現在、分子Aの合成、単離、ctDNAとの結合能について検討中である。
３．Long fragmentの存在部位、extracellular vesicle(EV) との関連について: 上記の検討と共に、EVに内包ないしは結合によりlong fragmentが保護されている可能性について検討した。遠心条件を変え、種々のサイズのEVを抽出し、DNAサイズ、ctDNA含有量について検討中である。まず、肺癌細胞株培養上清よりEVを単離し、そのサイズ、表面マーカーの解析を行い、現在ヒト血漿DNAの解析に着手している。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
これまで、肺がん患者の血漿検体を保管していたため、臨床的検討を迅速に行う事ができた。ctDNAサイズ解析、各ピークからのDNA抽出もそれまで解析準備を行っていたことから、計画通り進行する事ができた。
|
| Strategy for Future Research Activity |
1.Long fragmentの存在機序について ①会合分子の同定: long fragment、short fragmentのDNAを各々抽出し、次世代シークエンス解析の外注解析を行った。進行肺がん患者と共にコントロールとして健常人血漿遊離DNAも同時に検査に供した。その結果、分子Aが候補として同定された。分子Aの合成、単離は終了している。次にDNAとの結合性について、まず合成DNAと、次にヒトから抽出したctDNAとの結合能について検討する。②extracellular vesicle(EV) との関連について: 上記の検討と共に、EVに内包ないしは結合によりlong fragmentが保護されている可能性について検討を継続する。まず、肺癌細胞株培養上清よりEVを単離し、そのサイズ、表面マーカーの解析を行い、現在ヒト血漿DNAの解析に着手する。
2.2峰性ピークの各DNAおよび会合分子ががん進展に関与するか
１の結果に基づき、がんの浸潤、転移におけるctDNA、さらにlong fragment、short fragmentの効果について検討する。
|
-
-
[Journal Article] Phase II trial of gefitinib plus pemetrexed after relapse using first-line gefitinib in patients with non-small cell lung cancer harboring EGFR gene mutations2018
Author(s)
2.Uchibori K, Satouchi M, Sueoka-Aragane N, Urata Y, Sato A, Imamura F, Inoue T, Tachihara M, Kobayashi K, Katakami N, Kokan C, Hirashima T, Iwanaga K, Mori M, Aoe K, Morita S, Negoro S
-
Journal Title
Lung Cancer
Volume: 124
Pages: 65-70
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Current Status and Problems of T790M Detection, a Molecular Biomarker of Acquired Resistance to EGFR Tyrosine Kinase Inhibitors, with Liquid Biopsy and Re-biopsy2018
Author(s)
5.Komiya K, Nakashima C, Nakamura T, Hirakawa H, Abe T, Ogusu S, Takahashi K, Takeda Y, Egashira Y, Kimura S, Sueoka-Aragane N
-
Journal Title
Anticancer Res
Volume: 38
Pages: 3559-3566
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
