多種癌での免疫チェックポイント分子高発現を来すゲノム構造異常の同定と検出法の確立

2018 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 17K07205
• Research Institution: Japanese Foundation for Cancer Research
• Principal Investigator: 坂田 征士 公益財団法人がん研究会, がん研究所 分子標的病理プロジェクト, 研究員 (00617433)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: バイオマーカー

Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、腫瘍細胞における抑制性免疫チェックポイント分子の発現上昇をきたすゲノム構造異常の同定とその検出法を確立する、ことである。近年、構造異常に伴うprogramed cell death-ligand 1 (PD-L1) 遺伝子の 3´非翻訳領域の欠損や変異がPD-L1の高発現のメカニズムの一つとして明らかにされ、その異常は抗PD-1/PD-L1抗体薬の有用な効果予測マーカーとして期待されている。PD-L1が様々な腫瘍で発現していることが報告されており、それらの発現上昇をき
たすゲノム構造異常を同定し、その異常の検出法を確立する。
2018年度は、リンパ腫のtissue micro arrayを使用し、異なる抗PD-L1抗体による免疫染色とPD-L1遺伝子領域に特異的なfluorescence in situ hybridization（FISH）プローブを用いてスクリーニングを行い、PD-L1高発現をきたすゲノム構造異常陽性候補症例を検索した。免疫染色でのスクリーニングでは、約100例の高発現例を認めた。高発現を示す症例には、異なる抗PD-L1抗体での発現乖離などの異常な発現を示す症例も認められた。FISHでのスクリーニングでは、数十例の高発現症例に明らかな構造異常を示す所見が認められた。
2017年度、2018年度のスクリーニングで得られた候補症例の中で凍結検体からDNAが抽出できた症例に対し、targeted-capture sequencingを行いPD-L1遺伝子のゲノム構造異常を検索した。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

スクリーニングを終え、候補症例に対しtargeted-capture sequencingを行った。

Strategy for Future Research Activity

Targeted-capture sequencingの解析結果と免疫染色、FISH所見などを比較、検討する。

Research Products

• [Journal Article] Secreted PD-L1 variants mediate resistance to PD-L1 blockade therapy in non-small cell lung cancer (2019)
  • Author(s): Gong Bo, Kiyotani Kazuma, Sakata Seiji, Nagano Seiji, Kumehara Shun, Baba Satoko, Besse Benjamin, Yanagitani Noriko, Friboulet Luc, Nishio Makoto, Takeuchi Kengo, Kawamoto Hiroshi, Fujita Naoya, Katayama Ryohei
  • Journal Title: The Journal of Experimental Medicine Volume: 216 Pages: 982～1000
  • DOI: 10.1084/jem.20180870
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Frequent structural variations involving programmed death ligands in Epstein-Barr virus-associated lymphomas (2019)
  • Author(s): Kataoka Keisuke, Miyoshi Hiroaki, Sakata Seiji, Dobashi Akito, Couronne Lucile, Kogure Yasunori, Sato Yasuharu, Nishida Kenji, Gion Yuka, Shiraishi Yuichi, Tanaka Hiroko, et al
  • Journal Title: Leukemia Volume: Epub ahead of print Pages: -
  • DOI: 10.1038/s41375-019-0380-5
  • Peer Reviewed