2019 Fiscal Year Research-status Report
Quality control of protein in cardiomyochyte by atrial fibrillation associated gene, NEURL1
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17K07251
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
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Principal Investigator |
江花 有亮 東京医科歯科大学, 統合研究機構, 講師 (60517043)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | NEURL / mTOR |
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| Outline of Annual Research Achievements |
GWAS[1]で使用された全てのSNVのP値、染色体上の位置情報、オッズ比のファイルを作成する。MATLAB（R2018a）をプラットフォームとするコンピューティング言語でプログラムされたMAGENTAにより解析したところ、CTCF経路とmTOR経路が同定された。CTCF経路とmTOR経路の関与を確認するために、本学心臓外科で採取した既存試料（僧帽弁膜症症例）11検体を用いて、Microarray解析を実施した。心房細動患者と非心房細動患者で2つの経路の関与を調べたところ、心房細動患者から採取された心房筋においてはmTOR経路が抑制されていることが示された[2]。
次に同定されたユビキチン・リガーゼNEURLのmTOR経路への作用を調べるために、mTORC1複合体に含まれる分子およびmTORC2に含まれる分子のタンパク・リン酸化レベルの変化を調べた。HL-1細胞をsiNEURL, siCtrlでノックダウン処理をして、PRAS40を調べたところ、いずれも遺伝子発現抑制は認められなかった。そこで、再度LC-MS/MS分析を実施したところ、BAG6, PRKAR1Aが同定された。siNEURL, siCtrlで比較したところ、遺伝子発現に有意差を認めた。また、既報でCPEBファミリーの発現レベルへの影響について調べたところ、CPEB2およびCPEB4で有意差を認めたが、最終的な関与は否定された。
[1]Sinner, Ebana, Furukawa, Ellinor et al. Circulation (2014) 130 15:1225-35
[2]Ebana, Sun. Internationa Journal of Cardiology: Heart and Vasculature (2019) 4;24:100383
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の目的はGWASから同定されたCTCF経路とmTOR経路の心房細動発症との関与を確認するために、本学心臓外科で採取した既存試料（僧帽弁膜症症例）11検体を用いて、Microarray解析を実施した。バイオインフォマティクス解析から心房細動患者と非心房細動患者で2つの経路の関与を調べたところ、心房細動患者から採取された心房筋においてはmTOR経路が抑制されていることが示された。
次に同定されたユビキチン・リガーゼNEURLのmTOR経路への作用を調べるために、文献レベルで検索を行い、mTORC1複合体に含まれる分子およびmTORC2に含まれる分子のタンパク・リン酸化レベルの変化を調べた。HL-1細胞をsiNEURL, siCtrlでノックダウン処理をして、PRAS40を調べたところ、いずれも遺伝子発現抑制は認められなかった。そこで、再度LC-MS/MS分析を実施したところ、BAG6, PRKAR1Aが同定された。siNEURL, siCtrlで比較したところ、遺伝子発現に有意差を認めた。また、既報でCPEBファミリーの発現レベルへの影響について調べたところ、CPEB2およびCPEB4で有意差を認めたが、最終的な関与は否定された。
現時点では、NEURLとmTORには機能的な相関があるということは判明しているが、その機序は依然不明なままである。現在はNEURLのノックダウンによってHL-1細胞の構造異常を認めたため、その機能解析を進めている。
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| Strategy for Future Research Activity |
次に同定されたユビキチン・リガーゼNEURLのmTOR経路への作用を調べるために、文献レベルで検索を行い、mTORC1複合体に含まれる分子およびmTORC2に含まれる分子のタンパク・リン酸化レベルの変化を調べた。HL-1細胞をsiNEURL, siCtrlでノックダウン処理をして、PRAS40を調べたところ、いずれも遺伝子発現抑制は認められなかった。そこで、再度LC-MS/MS分析を実施したところ、BAG6, PRKAR1Aが同定された。siNEURL, siCtrlで比較したところ、遺伝子発現に有意差を認めた。また、既報でCPEBファミリーの発現レベルへの影響について調べたところ、CPEB2およびCPEB4で有意差を認めたが、最終的な関与は否定された。
現時点では、NEURLとmTORには機能的な相関があるということは判明しているが、その機序は依然不明なままである。現在はNEURLのノックダウンによってHL-1細胞の構造異常を認めたため、その機能解析を進めている。より具体的には、アクチンの分解が認められたため、ユビキチン機構とアクチン分解機構について解析を進めることが考えられる。ユビキチン機構の中のシャペロンたんぱく質のアクチン分解関与は心房細動発症モデル動物でも示されており、可能性の高い候補分子であると考えている。また細胞の表現型について、細胞質に見られた空胞形成について電子顕微鏡で形態解析をすることで解明の一助になると考えられた。
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| Causes of Carryover |
新型コロナウイルスの影響で参加予定であった日本循環器学会、欧州不整脈学会が夏以降に延期、あるいは中止となった。その分の経費を2020年度に持ち越し、学会に参加する予定である。
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