Analysis of the genetic mechanism repressing seed maturation program after germination using high-throughput sequencer

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17K07454
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Plant molecular biology/Plant physiology
• Research Institution: Chubu University
• Principal Investigator: SUZUKI Takamasa 中部大学, 応用生物学部, 准教授 (50535797)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 植物 / 種子 / 遺伝子発現 / オレオシン / スプライシング / イントロン

Outline of Final Research Achievements

An Arabidopsis mutant named defective repression of OLE3::LUC 1 (drol1) was originally isolated as a mutant with defects in the repression of OLEOSIN gene after seed germination. Since the DROL1 gene was speculated to encode a splicing factor, the transcriptome of drol1 mutant was compared to that of the wild type. The analysis revealed that the introns with AT-AC terminal sequences were specifically retained in the transcriptome of drol1, indicating that DROL1 was required for the splicing of AT-AC-type introns. This result suggested the existence of new subclasses spliceosome specifically excising introns with AT-AC terminal dinucleotides.

Free Research Field

植物分子遺伝学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

研究の結果シロイヌナズナのDROL1遺伝子は末端の塩基配列がAT-ACである極一部のイントロンのスプライシングに必要なものであることがわかった。イントロンのスプライシングはスプライソソームによって行われており、そのスプライソソームには2種類あることが知られている。しかし私たちの研究の結果、スプライソソームにはさらに細かい差を持つものがあることが示唆された。従来イントロンはその内部配列によって分けられ、それに応じたスプライソソームがあるとされていたが、この研究の結果からは末端の塩基配列もスプライソソームの選択性に影響を与えることが示唆された。