2019 Fiscal Year Annual Research Report
H3K9me independent role of heterochromatin protein 1 (HP1)
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17K07496
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Research Institution | Hokkaido University |
Principal Investigator |
高畑 信也 北海道大学, 理学研究院, 助教 (50381588)
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Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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Keywords | antisense RNA / HP1 / FACT / Swi6 / Spt16 / Pob3 / Hmo1 / Sap1 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究課題はヘテロクロマチン領域以外で機能するヘテロクロマチンタンパク質HP1の解析を行い、特に転写終結点に結合するHP1について以下の3つの目的を掲げて研究を推進して以下の結果を得た。 1.ヒストンH3K9me非依存的にHP1/Swi6と結合する因子の探索:LC-ms/ms解析から新たにHmo1とSap1を同定した。両者はそれぞれrDNA領域と複製開始点付近で働くことが報告されており、ChIP法、co-IP、リコンビナントタンパク質による試験管内結合解析を実施して確かに有意に結合することを確認した確認した。 2.ヒストンH3K9me非依存的にHP1/Swi6が転写終結点に結合する分子基盤の解明:HP1/Swi6が非修飾型ヒストンH3テイルに結合することを合成ペプチドを用いた生化学的解析で明らかにした。 3.ヒストンH3K9me非依存的にHP1/Swi6が転写終結点に結合する生物学的意義の解明:近年、多くの遺伝子で転写終結点付近からantisenseの点sにゃが起きていることが報告されている。申請者はモデルとなるChIP-seq解析とRNA-seq解析を進めてモデルとなる遺伝子を策定してantisense RNAの発言メカニズムに関する解析を行った。 初期段階で目標1をベースとして目標2と目標3へと研究を進める事でHP1/Swi6の未知機能解明に繋がるように計画を立て、また1に該当する因子として既にFACTを同定しておりFACTとHP1/Swi6の共役を1つのモデルケースと考え、他の新規因子解析に応用して計画を進めた。
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[Journal Article] 1. Regulation of ectopic heterochromatin-mediated epigenetic diversification by the JmjC family protein Epe1.2019
Author(s)
Sorida M, Hirauchi T, Ishizaki H, Kaito W, Shimada A, Mori C, Chikashige Y, Hiraoka Y, Suzuki Y, Ohkawa Y, Kato H, Takahata S, Murakami Y.
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Journal Title
PLoS Genet.
Volume: 15(6)
Pages: e1008129
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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