2019 Fiscal Year Annual Research Report
Identification of virulence factor of brown planthopper against resistant rice
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17K07687
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| Research Institution | National Agriculture and Food Research Organization |
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Principal Investigator |
小林 徹也 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 本部経営企画部, 上級研究員 (90355321)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
真田 幸代 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, グループ長 (80533140)
松村 正哉 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 本部, 所長・部門長 (00370619) [Withdrawn]
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | トビイロウンカ / バイオタイプ / 虫害抵抗性 / 抵抗性品種 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
イネのトビイロウンカ抵抗性遺伝子Bph1を打破するウンカバイオタイプ２は遺伝的に安定した抵抗性打破因子を持つ。
昨年までの本研究における繰り返しの交配と連鎖解析により、このバイオタイプがもつBph1加害性と連鎖するウンカゲノム領域をnMB（非公表）まで絞り込んだ。
抵抗性打破遺伝子が存在するこのゲノム領域について、昨年までに標準ウンカ系統のゲノム配列を特定しているが、本年度は、交配親のひとつであるバイオタイプ１（Bph1非加害であり非加害遺伝子を持つ）のゲノム配列を詳細に解析するため、Chromiumロングシーケンスで得た配列と比較した。
結果、非加害バイオタイプの当該ゲノム領域において座乗する遺伝子とnon coding RNA、small RNAの全貌を明らかした。座乗する遺伝子について、それぞれの発現部位、発現量、コードするアミノ酸配列と推定される機能、シグナルペプチドの有無、バイオタイプ間の転写量の差異等を部分的に明らかにした。また、RNAi法による発現抑制実験を行い表現型の解析を行った。Non coding RNAは特定のゲノム領域に集中しており、加害性と強く連鎖していた。また、non coding RNAの発現量や発現パターンはバイオタイプ間で顕著な差があり、Bph1加害性に関与していることが強く示唆された。
さらに、現在配列情報が不足しているscaffold間や、scaffold内のコンティグ間の配列ギャップを埋めるため、同じ系統のゲノムDNAについてPacBioシーケンシングにより解析してゲノムデータを得た。
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[Journal Article] Genome-wide Identi cation of Tebufenozide Resistant Genes in the smaller tea tortrix, Adoxophyes honmai (Lepidoptera: Tortricidae)2019
Author(s)
Miwa Uchibori-Asano, Akiya Jouraku, Toru Uchiyama, Kakeru Yokoi, Gaku Akiduki, Yoshitaka Suetsugu, Tetsuya Kobayashi, Akihito Ozawa, Saki Minami, Chiharu Ishizuka, Yoshiaki Nakagawa, Takaaki Daimon, Tetsuro Shinoda
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Journal Title
Scientific Reports
Volume: 9
Pages: 4203
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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