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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Identification of regulatory factors for somatic imprinted DMR establishment and elucidation of their molecular mechanisms

Research Project

Project/Area Number 17K08687
Research InstitutionSaga University

Principal Investigator

副島 英伸  佐賀大学, 医学部, 教授 (30304885)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywordsゲノムインプリンティング / DNAメチル化 / メチル化可変領域 / 遺伝子発現
Outline of Annual Research Achievements

一次スクリーニングで得られた6つの候補遺伝子に対してCRISPR-Cas9システムを用いたknockout(KO)による二次スクリーニングを行った。各遺伝子をKOした複数のクローンを取得し、DNAメチル化パターンを解析したところ、4遺伝子では未分化状態でDMRであるべきAirnプロモーター領域が脱メチル化していた。この結果から、これら4遺伝子は候補遺伝子から除外した。現在、残りの2遺伝子は現在スクリーニング中である。
一方、インプリントDMRのメチル化制御機構の観点から、Kcnq1ot1/Cdkn1cインプリントドメインを対象としてマウスを用いた解析を行った。このドメインのICRはKvDMR1であり、そのメチル化の確立には卵成熟過程でKcnq1が転写されることが必要であることが知られている。ドメイン内にエンハンサーと推測される領域が2カ所あることから、このエンハンサーがKcnq1に対して作用すると仮定し、母性アレルで欠失したマウス(ΔR1R2マウス)とエンハンサーを含む100 kbを母性欠失したマウス(Δ100 kbマウス)を作成した。KvDMR1のメチル化、Kcnq1ot1とCdkn1cの遺伝子発現量を解析したところ、KvDMR1はどちらのマウスでも正常メチル化を維持していた。一方、遺伝子発現では、ΔR1R2マウスは野生型と有意差のない発現量であったが、Δ100 kbマウスではKcnq1ot1の発現が有意に増加し、Cdkn1cが減少した。このことから、欠失領域にインプリントDMRのメチル化確立に関与するエンハンサーはないものの、Kcnq1ot1に対するリプレッサーが存在することが予想された。リプレッサーが欠失することで、Kcnq1ot1の発現が増加し、本領域のインプリンティングメカニズムに従ってCdkn1cが減少したと考えられた。

  • Research Products

    (17 results)

All 2019 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The extent of DNA methylation anticipation due to a genetic defect in ICR1 in Beckwith-Wiedemann syndrome2019

    • Author(s)
      Sun Feifei、Higashimoto Ken、Awaji Atsuko、Ohishi Kenji、Nishizaki Naoto、Tanoue Yuka、Aoki Saori、Watanabe Hidetaka、Yatsuki Hitomi、Soejima Hidenobu
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 64 Pages: 937~943

    • DOI

      10.1038/s10038-019-0634-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Habitual Light-intensity Physical Activity and ASC Methylation in a Middle-aged Population2019

    • Author(s)
      Nishida Yuichiro、Hara Megumi、Higaki Yasuki、Taguchi Naoto、Nakamura Kazuyo、Nanri Hinako、Horita Mikako、Shimanoe Chisato、Yasukata Jun、Miyoshi Nobuyuki、Yamada Yosuke、Higashimoto Ken、Soejima Hidenobu、Tanaka Keitaro
    • Journal Title

      International Journal of Sports Medicine

      Volume: 40 Pages: 670~677

    • DOI

      10.1055/a-0965-1374

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One week, but not 12?hours, of cast immobilization alters promotor DNA methylation patterns in the nNOS gene in mouse skeletal muscle2019

    • Author(s)
      Tomiga Yuki、Ito Ai、Sudo Mizuki、Ando Soichi、Eshima Hiroaki、Sakai Kazuya、Nakashima Shihoko、Uehara Yoshinari、Tanaka Hiroaki、Soejima Hidenobu、Higaki Yasuki
    • Journal Title

      The Journal of Physiology

      Volume: 597 Pages: 5145~5159

    • DOI

      10.1113/JP277019

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA methylation analysis of multiple imprinted DMRs in Sotos syndrome reveals IGF2 ‐DMR0 as a DNA methylation‐dependent, P0 promoter‐specific enhancer2019

    • Author(s)
      Watanabe Hidetaka、Higashimoto Ken、Miyake Noriko、Morita Sumiyo、Horii Takuro、Kimura Mika、Suzuki Takayuki、Maeda Toshiyuki、Hidaka Hidenori、Aoki Saori、Yatsuki Hitomi、Okamoto Nobuhiko、Uemura Tetsuji、Hatada Izuho、Matsumoto Naomichi、Soejima Hidenobu
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 34 Pages: 960~973

    • DOI

      10.1096/fj.201901757R

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ヒト疾患のエピゲノム2019

    • Author(s)
      副島英伸
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • Invited
  • [Presentation] 先天異常症候群のエピゲノム異常2019

    • Author(s)
      副島英伸
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • Invited
  • [Presentation] IGF2 overexpression due to IGF2-DMR0 hypomethylation in Sotos syndrome.2019

    • Author(s)
      Higashimoto K, Watanabe H, Miyake N, Morita S, Horii T, Maeda T, Hidaka H, Aoki S, Yatsuki H, Okamoto N, Hatada I, Matsumoto N, Soejima H.
    • Organizer
      The 59th Annual Meeting of The Japanese Teratology Society, The 13th World Congress of The International Cleft Lip and Palate Foundation
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Methylation anticipation extends to the outside of ICR1 in familial Beckwith-Wiedemann syndrome patients with ICR1 mutation.2019

    • Author(s)
      Sun F, Higashimoto K, Soejima H.
    • Organizer
      European Society of Human Genetics Conference 2019
  • [Presentation] Atypical DNA methylation defects of ICR1 cause two opposite imprinting disorders, Beckwith-Wiedemann syndrome and Silver-Russell syndrome.2019

    • Author(s)
      Soejima H, Sun F, Tanoue Y, Yatsuki H, Higashimoto K.
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] IGF2-DMR0はDNAメチル化依存的なIGF2 P0プロモーター特異的エンハンサーである-ソトス症候群のインプリントDMRのDNAメチル化解析から-2019

    • Author(s)
      東元健、渡邊英孝、三宅紀子、森田純代、堀居拓郎、畑田出穂、松本直通、副島英伸.
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] The extent of DNA methylation anticipation due to a genetic defect in ICR1 in Beckwith-Wiedemann syndrome.2019

    • Author(s)
      Sun F, Higashimoto K, Soejima H.
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第64回大会
  • [Presentation] 乳癌と卵巣癌を合併する症例の検討.2019

    • Author(s)
      大隈恵美、橋口真理子、山本徒子、西山哲、光貴子、中尾佳史、副島英伸、横山正俊.
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第64回大会
  • [Presentation] 本邦の間葉性異形成胎盤症例における妊娠高血圧症候群の発症に関する検討―PMD全国調査の副次的解析―.2019

    • Author(s)
      小寺千聡、大場 隆、副島英伸、片渕秀隆.
    • Organizer
      第40回日本妊娠高血圧学会学術集会
  • [Presentation] FACSと次世代シークエンサーを用いたshRNAライブラリースクリーニングによるポリコームサイレンシング制御因子の探索2019

    • Author(s)
      西岡憲一、宮_仁美、副島英伸.
    • Organizer
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Presentation] DNA methylation anticipation due to ICR1 mutation in familial Beckwith-Wiedemann syndrome patients.2019

    • Author(s)
      Sun F, Higashimoto K, Soejima H. The extended
    • Organizer
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Book] 基礎と臨床の両側面からみた胎盤学2019

    • Author(s)
      日本胎盤学会
    • Total Pages
      448
    • Publisher
      メジカルビュー社
    • ISBN
      978-4-7583-1762-7
  • [Remarks] 佐賀大学医学部分子生命科学講座分子遺伝学・エピジェネティクス分野

    • URL

      http://www.biomol.med.saga-u.ac.jp/mbg/index.htm

URL: 

Published: 2021-01-27  

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