2019 Fiscal Year Annual Research Report
Copy number alterations in biliary tract cancer using crypt isolation technique
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17K08701
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| Research Institution | Iwate Medical University |
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Principal Investigator |
塩井 義裕 岩手医科大学, 医学部, 研究員 (00714346)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菅井 有 岩手医科大学, 医学部, 教授 (20187628)
石田 和之 岩手医科大学, 医学部, 准教授 (40444004)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | SNP array / コピー数異常 / 胆道癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
胆道癌の手術材料から分離腺管を採取してDNAを抽出し，CytoScan 750K(Affimetrix)を用いて胆道癌のコピー数解析を行った．肝外胆管癌25例と胆嚢癌11例について解析した．1．胆管癌と胆嚢癌のCNAがみられた遺伝子座数の比較
胆管癌と胆嚢癌でCNAがみられた遺伝子座数を比較すると，CNAがみられる総遺伝子座数は，胆管癌に有意に多く見られ（p=0.0371），Gain，LOH，CN-LOH別では，LOHは胆管癌に有意に多くみられ（p=0.0175），GainおよびCN-LOHでは両群間に有意差はなかった．胆管癌と胆嚢癌間で有意なCNA変化を示す遺伝子座数は2か所みられ，その部位は7q21.3, 7q22.1のGainであった．
2．胆道癌36例についての層別化解析
胆管癌（25例）と胆嚢癌（11例）を含めた胆道癌36例について，コピー数異常に基づき階層的クラスター解析を行ったところ，2群に分かれた．subgroup 2に対し、subgroup 1では有意に胆嚢癌が多い結果であった.（p=0.0027）subgroup 1とsubgroup 2の比較においてCNAがみられる総遺伝子座数は Subgroup2で有意に多くみられた．（p<0.0001） GainおよびLOHは，subgroup 2で有意に多くみられた.（それぞれp<0.0001, p<0.0001）２つのsubgroup間で有意なCNA変化を示すlocus数を検索した。233箇所に有意な差がみられ，Gainが195箇所，LOHが35箇所，CN-LOHが3箇所で有意なCNA変化がみられた．
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Research Products
(4 results)
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[Journal Article] The expression of gastrointestinal differentiation markers in extrahepatic cholangiocarcinoma: clinicopathological significance based on tumor location.2019
Author(s)
Ishida K, Osakabe M, Eizuka M, Tai S, Sugimoto R, Fujita Y, Katagiri H, Takahara T, Uesugi N, Nitta H, Sasaki A, Sugai T.
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Journal Title
Hum Pathol
Volume: 92
Pages: 91-100
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Clinicopathological and Molecular Findings of Differentiated-Type Minute Gastric Intramucosal Neoplasia.2019
Author(s)
Uesugi N, Sugai T, Sugimoto R, Eizuka M, Fujita Y, Sato A, Osakabe M, Ishida K, Shiomi E, Toya Y, Akasaka R, Matsumoto T.
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Journal Title
Digestion.
Volume: Apr 3
Pages: 1-11
DOI
Peer Reviewed
