2018 Fiscal Year Research-status Report
特発性間質性肺炎に合併する肺腺癌の病理学的特性と組織発生
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17K08724
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
奥寺 康司 横浜市立大学, 医学部, 准教授 (10326027)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
宮城 洋平 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), 臨床研究所, 所長 (00254194)
横瀬 智之 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), その他部局等, その他 (10221665)
荒井 宏雅 横浜市立大学, 医学研究科, 客員講師 (10381493)
立石 陽子 横浜市立大学, 医学部, 助教 (20644438)
梅田 茂明 横浜市立大学, 附属病院, 助教 (30644439)
大橋 健一 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (40231203)
石川 善啓 横浜市立大学, 附属病院, 助教 (40384838)
禹 哲漢 横浜市立大学, 医学部, 講師 (90537177)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 肺癌 / 間質肺炎 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
①解析対象の選抜：間質性肺炎に合併する肺腺癌のうち典型的と考えられる病変を選抜する。過去の報告および申請らのこれまでの研究成果に基づいて次の３つの条件を満たすものを典型病変と定義した。すなわち、ア）蜂巣肺において気管支上皮化生と連続して発生した、イ）気管支表面上皮型細胞亜型の腺癌で、ウ）既知のドライバー遺伝子（EGFR、ALK、RET、ROS1、KRAS、BRAF）のいずれにも変異のないものとし、10病変を選抜した。
②マイクロダイセクション法による細胞分離：上記①で選抜した10病変からマイクロダイセクション法で、がん細胞、気管支上皮化生細胞、健常部の気管支上皮細胞を選別して採取する。それぞれからDNAを抽出した。
③次世代シーケンサーによる全エクソン変異検索：10病変からうち2病変の健常部、気管支上皮化生、腫瘍部分を選抜採取し、100リード以上のディープシーケンスを行った（当初、全エクソン解析を予定であったが、ディープに読んで低頻度の変異を検出するため250種のがん関連遺伝子を網羅するパネル解析に変更した）。
④データ解析：目下、変異遺伝子のその頻度を解析中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
気管支上皮化生病変を扱う作業では、病変が非常に小さく、予想以上にDNAの抽出量が少なかったため、十分な量を得るための病変の選抜と、繰り返しのマイクロダイセクションが必要であり、難渋した。また、解析前のクオリティーチェックまでパスしたものは、結果として当初の10病変を選抜したものの、ここまでで、2病変を健常部、がん部、化生部に分けて解析することができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
①データ解析：今回の解析データと複数のウェブサイトで公開されているデータベースを比較しながら有意と考えられる遺伝子変異を抽出する。
②遺伝子変異の検証：網羅的変異検索に用いた病変を対象に、ここまでで抽出した遺伝子変異について、ダイレクトシーケンス法で解析し、網羅的変異検索の結果を検証する。
③解析対象の拡張：間質性肺炎に合併した肺腺癌と通常の腺癌を対象（50～100例）に、②で検証された遺伝子変異について、ダイレクトシーケンス法（塩基置換レベルの変異の場合）で解析し、真に間質性肺炎に合併した肺腺癌に特異的(あるいは特徴的）な遺伝子変異であるかどうかを検証する。
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| Causes of Carryover |
気管支上皮化生病変を扱う作業では、病変が非常に小さく、予想以上にDNAの抽出量が少なかったため、十分な量を得るための病変の選抜と、繰り返しのマイクロダイセクションが必要であり、難渋した。研究計画が遅延したため。
残額は、これまで遅延した実験と、変更したパネル解析を、追加症例で行うために使用する。
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Research Products
(3 results)
