Clarification of interaction machinery between antiviral factor APOBEC3G and HIV-1 Vif

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17K08872
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Virology
• Research Institution: National Hospital Organization Nagoya Medical Center
• Principal Investigator: Ode Hirotaka 独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, 研究員 (20754162)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: APOBEC3G / APOBEC3 / Vif / タンパク質複合体構造予測 / HIV-1 / タンパク質-タンパク質相互作用

Outline of Final Research Achievements

Human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) encodes vif gene, of which product counteracts human anti-HIV-1 factor, APOBEC3 proteins. The objective of the study is to clarify 3D complex structure between human APOBEC3 proteins and Vif and to understand interactions of them. The complex structure was predicted by several computational simulation techniques based on publically available structure information on APOBEC3 proteins and Vif. The previously reported experimental data for the binding was supported by the predicted complex structures, suggesting that the predicted structures are reasonable.

Free Research Field

生物物理学、ウイルス学、情報生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

HIV-1感染症には治癒させる薬がないため、新しい作用機序を持つ薬の開発が期待されている。これら研究成果は、抗HIV-1因子APOBEC3タンパク質あるいはHIV-1 Vifを標的とした新しい抗HIV-1薬開発の基盤となる構造情報であると言える。さらに、この構造情報は、HIV-1がサルからヒトへと伝播していく際に、どのように種の壁を乗り越えてきたか、または、HIV-1やほかのウイルスの進化を理解する手がかりにもなると考えられる。