2017 Fiscal Year Research-status Report
Genome-wide analysis of copy number variations in individual differences in vulnerability to and severity of substance dependence regarding nicotine and other addictive substances
| Project/Area Number |
17K08970
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
|---|
Principal Investigator |
西澤 大輔 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 主席研究員 (80450584)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池田 和隆 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 分野長 (60281656)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
|
| Keywords | ニコチン依存 / 物質依存脆弱性 / コピー数多型・変異 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
[目的] 近年、ゲノムワイド遺伝子多型解析等によりニコチン等の物質依存脆弱性や重症度個人差の遺伝要因が明らかにされつつあるが、欧米人と比較して日本人サンプルにおける喫煙行動の遺伝要因の研究は大きな進展を遂げていない。本研究では、代表研究者らの所属研究室においてこれまで収集された日本人サンプルに対してゲノムワイドコピー数変異・多型関連解析を行い、ニコチン等の物質依存脆弱性や重症度と関連する遺伝子多型を網羅的に探索する。
[方法] 喫煙情報の付随するがん・糖尿病・高血圧患者300名を対象とした。合計約30万のマーカー遺伝子多型を解析するアレイHumanCytoSNP-12及びiScan Systemを用いたInfinium assay法によるマーカーの判定後、コピー数変異・多型解析用ソフトウェアによりコピー数変異・多型を検出し、上記サンプルの解析を行う。得られたデータを、現有の統計解析用ソフトウェアを用いて統計学的に解析し、ニコチン依存脆弱性・重症度とコピー数変異・多型との関連を見出す。
[結果] 対象症例において、0～22番常染色体及びX染色体上に合計151のCNV領域が検出された。一日本数（CPD）、Fagerström Test for Nicotine Dependence (FTND) score、Tobacco Dependence Screener (TDS) score、の表現型に対してこれらのCNVとの関連解析を行ったところ、APOBEC3B遺伝子領域に位置する約20kbpのCNVがFTND scoreと有意な関連を示した。
[結論] 今後さらなる再現性検証研究が必要とされるが、本研究において同定されたAPOBEC3B遺伝子領域のCNVは、日本人においてニコチン依存重症度に関連する有力候補CNVである可能性が示唆された。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当該年度の研究において、解析はほぼ予定通り進行し、ニコチン依存重症度に関連すると考えられる有力候補CNVが同定されたため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
今後は、当該年度までの研究において行っていた解析と同様の解析を引き続き行う。すなわち、当該年度には解析対象としていない、喫煙情報の付随するがん・糖尿病・高血圧患者のサンプルに関する独立した全ゲノムジェノタイピングデータを用い、ニコチン等の物質依存脆弱性や重症度に関連するCNVを同定する。さらに、比較的頻度の高いCNVに対しては、commonな一塩基多型などの場合と同様に、物質依存脆弱性や重症度の指標となる臨床データを用いて関連解析を行う。これらの解析において有意な関連が見出されたCNVに関しては、文献検索及びリアルタイム定量PCR（qPCR）による追加解析等を含めた詳細な検討を行い、最有力候補構造多型・変異（最もcausativeと考えられるCNV及びその遺伝子）を同定する。
|
| Causes of Carryover |
（理由）
基本的には当初の研究期間内に全額を使用すべく計画的に執行したが、本研究を遂行するために最適と思われる試薬（キット）の最新情報開示が翌年度とわかり、試薬の選定および購入が翌年度になったため、本年度達成できなかった試薬の購入、実験、及び解析を次年度に行うこととなった。
（使用計画）
物品費（実験用試薬及びプラスチック製品等）、旅費（研究成果発表目的の国内外旅費及び研究打合せ目的の出張費等）、その他等（印刷費及び研究成果発表費用（論文校閲・別刷費用）等）に対して使用予定である。
|
-
-
[Journal Article] Genome-wide scan identifies candidate loci related to remifentanil requirements during laparoscopic-assisted colectomy2018
Author(s)
Nishizawa D, Mieda T, Tsujita M, Nakagawa H, Yamaguchi S, Kasai S, Hasegawa J, Fukuda K, Kitamura A, Hayashida M, Ikeda K
-
Journal Title
Pharmacogenomics
Volume: 19(2)
Pages: 113-127
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
[Journal Article] Paclitaxel-induced sensory peripheral neuropathy is associated with an ABCB1 single nucleotide polymorphism and older age in Japanese2017
Author(s)
Tanabe Y, Shimizu C, Hamada A, Hashimoto K, Ikeda K, Nishizawa D, Hasegawa J, Shimomura A, Ozaki Y, Tamura N, Yamamoto H, Yunokawa M, Yonemori K, Takano T, Kawabata H, Tamura K, Fujiwara Y
-
Journal Title
Cancer Chemother Pharmacol
Volume: 79(6)
Pages: 1179-1186
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
[Journal Article] ゲノムワイド関連解析 (GWAS) による腹腔鏡補助下大腸切除術後フェンタニル必要量に影響する遺伝子多型の同定2017
Author(s)
西澤大輔, 三枝勉, 辻田美紀, 天野功二郎, 田代浄, 石井利昌, 山口茂樹, 笠井慎也, 長谷川準子, 池田和隆, 北村晶, 林田眞和
-
Journal Title
日本神経精神薬理学雑誌
Volume: 37(2)
Pages: 53-54
-
-
[Presentation] ゲノムワイド関連解析（GWAS）による慢性疼痛感受性遺伝子多型の同定2017
Author(s)
西澤大輔, 有田英子, 花岡一雄, 矢島直, 井関雅子, 加藤実, 小川節郎, 平沼彩子, 笠井慎也, 長谷川準子, 林田眞和, 池田和隆
Organizer
日本人類遺伝学会第62回大会
-
[Presentation] Genome-wide association study identifies candidate loci associated with intraoperative remifentanil requirements during laparoscopic-assisted colectomy2017
Author(s)
Nishizawa D, Mieda T, Tsujita M, Nakagawa H, Yamaguchi S, Kasai S, Hasegawa J, Fukuda K, Kitamura A, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
The American Society of Human Genetics 67th Annual Meeting
Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Associations between polymorphisms close to the cAMP responsive element binding protein 1 (CREB1) gene and the activating transcription factor 2 (ATF2) gene and fentanyl sensitivity2017
Author(s)
Aoki Y, Nishizawa D, Yoshida K, Hasegawa J, Kasai S, Takahashi K, Koukita Y, Ichinohe T, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
5th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP 2017)
Int'l Joint Research
-
-
-
-
