2019 Fiscal Year Annual Research Report
Genome-wide analysis of copy number variations in individual differences in vulnerability to and severity of substance dependence regarding nicotine and other addictive substances
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17K08970
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
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Principal Investigator |
西澤 大輔 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 主席研究員 (80450584)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池田 和隆 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 分野長 (60281656)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | ニコチン依存 / 物質依存脆弱性 / コピー数多型・変異 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
[目的] 近年、ゲノムワイド遺伝子多型解析等によりニコチン等の物質依存脆弱性や重症度個人差の遺伝要因が明らかにされつつあるが、欧米人と比較して日本人サンプルにおける喫煙行動の遺伝要因の研究は大きな進展を遂げていない。本研究では、代表研究者らの所属研究室においてこれまで収集された日本人サンプルに対してゲノムワイドコピー数変異・多型関連解析を行い、ニコチン等の物質依存脆弱性や重症度と関連する遺伝子多型を網羅的に探索する。
[方法] 喫煙情報の付随するがん・糖尿病・高血圧患者192名を対象とした。合計約50万以上のマーカー遺伝子多型を解析するアレイHumanCoreExome及びiScan Systemを用いたInfinium assay法によるマーカーの判定後、コピー数変異・多型解析用ソフトウェアによりコピー数変異・多型を検出し、上記サンプルの解析を行う。得られたデータを、現有の統計解析用ソフトウェアを用いて統計学的に解析し、ニコチン依存脆弱性・重症度とコピー数変異・多型との関連を見出す。
[結果] 対象症例において、0～22番常染色体及びX染色体上に合計198のCNV領域が検出された。一日本数（CPD）、Fagerstroem Test for Nicotine Dependence (FTND) score、Tobacco Dependence Screener (TDS) score、の表現型に対してこれらのCNVとの関連解析を行ったところ、PLXDC1遺伝子領域近傍に位置する約3kbpのCNVがTDS scoreと有意な関連を示した。
[結論] 今後さらなる再現性検証研究が必要とされるが、本研究において同定されたPLXDC1遺伝子領域近傍のCNVは、日本人においてニコチン依存重症度に関連する有力候補CNVである可能性が示唆された。
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[Journal Article] Taxane-induced sensory peripheral neuropathy is associated with an SCN9A single nucleotide polymorphism in Japanese patients2020
Author(s)
Tanabe Y, Shiraishi S, Hashimoto K, Ikeda K, Nishizawa D, Hasegawa J, Shimomura A, Ozaki Y, Tamura N, Yunokawa M, Yonemori K, Takano T, Kawabata H, Tamura K, Fujiwara Y, Shimizu C
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Journal Title
BMC Cancer
Volume: 20(1)
Pages: 325
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] A single medical marker for diagnosis of methamphetamine addiction - DNA methylation of SHATI/NAT8L promoter sites from patient blood2020
Author(s)
Kusui Y, Nishizawa D, Hasegawa J, Uno K, Miyanishi H, Ujike H, Ozaki N, Inada T, Iwata N, Sora I, Iyo M, Yamada M, Kondo N, Won MJ, Naruse N, Uehara-Aoyama K, Ikeda K, Nitta A
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Journal Title
Curr Pharm Des
Volume: 26(2)
Pages: 260-264
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Adiponectin receptor 1 gene is potentially associated with severity of postoperative pain but not cancer pain2020
Author(s)
Ninagawa J, Sumitani M, Nishizawa D, Nagashima M, Mietani K, Abe H, Inoue R, Hozumi J, Tsuchida R, Ikeda K, Yamada Y
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Journal Title
Medicine
Volume: 99(5)
Pages: e18924
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] ゲノムワイド関連解析(GWAS)による慢性痛及び帯状疱疹後神経痛感受性遺伝子の同定2019
Author(s)
西澤大輔, 有田英子, 花岡一雄, 矢島直, 井関雅子, 加藤実, 小川節郎, 平沼彩子, 笠井慎也, 長谷川準子, 江畑裕子, 中山京子, 林田眞和, 池田和隆
Organizer
日本人類遺伝学会第64回大会
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[Presentation] Genome-wide association study identifies genetic polymorphisms and genes possibly associated with chronic pain and postherpetic neuralgia2019
Author(s)
Nishizawa D, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Kasai S, Hasegawa J, Ebata Y, Nakayama K, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
The American Society of Human Genetics 69th Annual Meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] Association between the rs11726196 Single-Nucleotide Polymorphism within the Transient Receptor Subfamily C Member 3 (TRPC3) Gene and Chronic Pain2019
Author(s)
Aoki Y, Nishizawa D, Yoshida K, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Hasegawa J, Kasai S, Takahashi K, Koukita Y, Ichinohe T, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
6th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP2019)
Int'l Joint Research
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[Presentation] Genome-wide association studies on chronic pain and effects of drugs for the treatment of pain2019
Author(s)
Nishizawa D, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Kasai S, Hasegawa J, Ebata Y, Nakayama K, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
6th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP2019)
Int'l Joint Research
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[Presentation] Associations between genetic polymorphisms on chromosome 14q32 and effects of opioid analgesics and chronic pain2019
Author(s)
Kosaki Y, Nishizawa D, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Kasai S, Hasegawa J, Nakayama K, Ebata Y, Koukita Y, Ichinohe T, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
6th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP2019)
Int'l Joint Research
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