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2018 Fiscal Year Research-status Report

PET/CT画像と病理画像を用いた肺癌診断用イメージングバイオマーカーの開発

Research Project

Project/Area Number 17K09070
Research InstitutionFujita Health University

Principal Investigator

寺本 篤司  藤田医科大学, 保健学研究科, 准教授 (00513780)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 塚本 徹哉  藤田医科大学, 医学部, 教授 (00236861)
今泉 和良  藤田医科大学, 医学部, 教授 (50362257)
外山 宏  藤田医科大学, 医学部, 教授 (90247643)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
KeywordsPET/CT / 病理画像 / 自動分類 / 肺癌
Outline of Annual Research Achievements

(1)症例の追加:前年度までに収集した症例数が十分でないため、新たに76症例の病理標本について画像収集を行った。
(2)深層学習による特徴量算出手法の開発:深層学習(ディープラーニング)法として、脳の認知プロセスにヒントを得て開発され、画像認識処理にて良好な識別精度を有する畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に注目した。PET/CT画像については、2種類の3次元画像から結節付近の画像パターンを切り出し、CNNに入力するようにした。病理画像については、細胞診および組織診のために顕微鏡で撮影されたカラー画像をCNNに入力した。そして、CNNの中間層では画像の特徴が抽出・圧縮された状態となっているため、CNNの中間層の数値を取り出し、特徴量とした。それらを機械学習法のひとつであるSupport Vector Machineによって悪性度を予測する方法を開発した。
(3)統計的手法を用いた特徴量の統合による画像バイオマーカーの生成:診断モデルに基づく画像特徴量と深層学習により得た画像特徴量を、統計的手法のひとつである主成分分析により解析し、情報の主成分となる数値群を画像バイオマーカーとして出力した。ここで、画像バイオマーカーは鑑別診断、確定診断でそれぞれ利用できる画像情報が異なるため、PET/CT画像と病理画像の特徴量は独立して算出した。
(4)妥当性評価:構築した画像データベースを用いて、画像バイオマーカー値と疾患との関連性を調査した。さらに、画像バイオマーカーを医師が利用した場合と利用しない場合の診断精度をROC解析により評価し、本手法の有効性を確認した。その結果、本研究で抽出した特徴量を組み合わせたほうが全体的に高い性能を示すことが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究に必要な症例もほぼ収集が完了し、当初の目的であった肺癌に関する画像バイオマーカーを算出するための基礎的な検討は完了した。深層学習(ディープラーニング)法として、脳の認知プロセスにヒントを得て開発され、画像認識処理にて良好な識別精度を有する畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いてPET/CTならびに病理画像から画像バイオマーカーを算出し、識別したところ良好な肺癌分類性能が得られた。

Strategy for Future Research Activity

今後は、肺癌に関するさらに良質な画像バイオマーカーを開発するため、3次元画像情報を深層学習法で直接処理し、画像の3次元的な形状特徴量を算出できるよう、改良を行う。また、研究成果をとりまとめ、論文発表や国際学会発表などを行なって、成果を公表する予定である。

Causes of Carryover

購入予定であった機器の値下がりなどがあり物品費が少なくなりました。また、データ解析を研究代表者・分担研究者のみで実施したため、謝金が生じませんでした。

  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Automated pulmonary nodule classification in computed tomography images using a deep convolutional neural network trained by generative adversarial networks2019

    • Author(s)
      Y.Onishi, A.Teramoto, M.Tsujimoto, T.Tsukamoto, K.Saito, H.Toyama, K.Imaizumi, H.Fujita
    • Journal Title

      BioMed Research International

      Volume: 6051939 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1155/2019/6051939

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 放射線診断領域における人工知能の応用2019

    • Author(s)
      寺本篤司,
    • Journal Title

      癌と化学療法

      Volume: 46 Pages: 418-422

  • [Journal Article] Automated classification of pulmonary nodules through a retrospective analysis of conventional CT and two-phase PET images in patients undergoing biopsy2018

    • Author(s)
      A.Teramoto, M.Tsujimoto, T.Inoue, T.Tsukamoto, K.Imaizumi, H.Toyama, K.Saito, H.Fujita
    • Journal Title

      Asia Oceania Journal of Nuclear Medicine and Biology

      Volume: 7 Pages: 29-37

    • DOI

      10.22038/AOJNMB.2018.12014

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Automated classification and segmentation of malignant pulmonary cells in the cytological image2018

    • Author(s)
      A.Teramoto, A.Yamada, Y.Kiriyama, T.Tsukamoto, Y.Ke, Z.Ling, RM.Summers, K.Saito, H.Fujita, "Automated classification and segmentation of malignant pulmonary cells in the cytological image," 4th Digit
    • Organizer
      4th Digital Pathology Congres Asia
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Fine-tuning deep convolutional neural networks for classification of lung cancer types from cytological images2018

    • Author(s)
      T.Tsukamoto, A.Teramoto, Y.Kiriyama, A.Yamada
    • Organizer
      4th Digital Pathology Congres Asia
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Automated classification of pulmonary nodule in CT images:Development of analysis method using multi DCNNs2018

    • Author(s)
      Y.Onishi, A.Yamada, M.Tujimoto, T.Inoue, A.Teramoto, K.Imaizumi, H.Toyama, K.Saito, H.Fujita
    • Organizer
      40th Annual International Conference of the IEEE EMBS
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Decision support system for lung cancer using PET/CT and microscopic images2018

    • Author(s)
      A.Teramoto, A.Yamada, T.Tsukamoto, Y.Kiriyama, M.Tsujimoto, T.Inoue, K.Imaizumi, H.Toyama, K.Saito, H.Fujita
    • Organizer
      40th Annual International Conference of the IEEE EMBS
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 3-Minute Recipe for Deep Learning: Principle, Hardware, and Software2018

    • Author(s)
      A.Teramoto, H.Fujita
    • Organizer
      RSNA2018
    • Int'l Joint Research
  • [Book] よくわかる医用画像情報学2018

    • Author(s)
      石田隆行監修
    • Total Pages
      14
    • Publisher
      オーム社
    • ISBN
      978-4-274-22131-6

URL: 

Published: 2019-12-27  

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