2018 Fiscal Year Research-status Report
Development visualization analysis system of multistate outbreak of enteric disease
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17K09149
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
八幡 裕一郎 国立感染症研究所, 感染症疫学センター, 主任研究官 (70346956)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 感染症 / 広域散発アウトブレイク / 公衆衛生対策 / 情報の可視化 / サーベイランス / 疫学調査 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
広域散発アウトブレイクは国内外で探知が難しく、重症例の発生時に探知されたり、広がりの大きい時点で探知がされたりすることが多い。一方で、アウトブレイクの探知は質の高いサーベイランスの構築により、アウトブレイクの早期探知及び早期対策が重要となる。
我が国では感染症発生動向調査における3類感染症は重症度が高く、広域に散発的に発生する消化器系の感染症が挙げられている。
本研究は国内で実施されている複数のサーベイランスデータ（患者情報、分子タイピングを含めた病原体情報）を集約し、可視化を行い、リアルタイムに迅速なアウトブレイクの探知を行うことで、迅速な公衆衛生上のアウトブレイク対応実施を行うことが目的である。
本研究で初年度に患者情報、分子タイピングの情報及び患者の行動歴や曝露情報に関するデータベースのフォーマットを構築した。今年度は構築したデータベースを用いて可視化のための描画プログラムを作成した。地域での発生分布（空間的発生状況）に関する描画プログラムは1)Google Maps Api及び2)SASを利用した地域の発生状況を作成した。時間的な発生状況は1)Java Script及び2)SASを利用した流行曲線の作成をした。また、異常値探知のアルゴリズムを作成した。作成した空間的発生状況と時間的な発生状況の図は協力自治体の担当者から利用に関する意見聴取を行った。協力自治体の担当者から、アウトブレイクに関する情報は気密性の高い情報であるとの指摘からオープンソースで、気密性の低い物に対する抵抗感があった。また、JavaScriptの利用できない自治体が存在することが判明した。
次年度はSASによる解析プログラムを中心に空間的及び時間的な発生状況に加え、行動歴や曝露情報に関する情報を含めた記述疫学の作成とともに、公衆衛生上の対策への可視化プログラム作成を行うことを目的に実施する予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
異常値の探知に関するアルゴリズムは作成したが、実際の発生状況のデータをもとに運用は行っていない。そのため、次年度に実際の発生状況のデータをもとに運用をしながら再検討の可能性がああることからである。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまで作成した空間的及び時間的発生状況に関する可視化プログラムを作成した。また、行動歴、曝露歴等に関する調査票およびデータベースの検討を行ってきた。今後の研究は実際のデータを利用し、1)可視化ツールの運用（地理的発生状況、時間的発生状況）、2)異常値の探知に関する運用と見直し、3)異常値探知後の行動及び曝露等の調査に関する情報の可視化を行い、Hypothesis generationのための可視化情報を作成し、公衆衛生対策に実用化できることを目標とする。
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| Causes of Carryover |
実際の運用のための機材の購入を行っていないため次年度利用するPC等の購入を行う予定である。また、海外の先進的な機関（CDC）への打ち合わせをの日程が合わず、渡航できなかったためである。次年度に実施する予定である。
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