2018 Fiscal Year Research-status Report
Analysis of signaling pathways identified by transcriptome analysis of rheumatoid arthritis samples
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17K09972
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
住友 秀次 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20392996)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 関節リウマチ / トランスクリプトーム解析 / パスウェイ解析 / 発現変動遺伝子 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
今年度は、関節リウマチ患者末梢血のCD4陽性T細胞亜分画のトランスクリプトーム解析(Sumitomo S, et al. Journal of Autoimmunity 2018;89:21-9)を基に、関節リウマチに特徴的な変化を呈する分画・遺伝子群・シグナル経路の抽出を試みたが、T細胞以外の細胞分画にも検索対象を広げた。我々の作成した、健常人の105名の末梢血5分画（CD4陽性T細胞、CD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、Monocyte）とSNPの遺伝子カタログ(Ishigaki K, et al. Nature Genetics 2017;49(5):110-5)を、関節リウマチのGWASデータと統合することで、関節リウマチのリスクSNPであるrs12529514がB細胞上のCD83の発現にeQTL効果を持っており、CD27－IgD－ double‐negative B cellsの比率と有意な相関があることを示した（Tsuchida Y, Sumitomo S, et al. Arthritis Rheumatol. 2018;70:1695-96）。また、第38回日本炎症・再生医学会では優秀演題賞を受賞し、学会誌に総説を掲載した（Sumitomo S, et al. Inflamm Regen. 2018;38:21）。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
今年度は、健常人末梢血遺伝子発現カタログをもとに、CD4陽性T細胞以外の細胞分画（CD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、Monocyte）にも解析対象を広げ、関節リウマチのリスクSNPでB細胞上の発現分子とB細胞亜分画比率との関係を明らかにすることができた。本リスクSNPはNF-kBの結合部位と強い関連があることも示されており、関節リウマチの病態との関連について検索を進めている。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在、関節リウマチ患者末梢血の詳細な亜分画の解析を行っており、どの細胞分画において、どのような遺伝子によって制御され、シグナルのどの部分が関節リウマチの病態と強く関連するのかを明らかにしつつある。今までに得られた、関節リウマチのCD4陽性T細胞における、mTORシグナル経路、酸化的リン酸化との関連、またB細胞とCD83との関連について、詳細な評価を試みている。
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| Causes of Carryover |
前年度の繰越金2,512円と併せて、275,561円の次年度使用額が発生した。これは、2019年3月末に発注を試みたが年度内に納品されない試薬があったためであり、2019年4月に試薬発注し、相当する金額を使用している。
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[Presentation] 関節リウマチ患者の末梢血CD4+T細胞で同定された疾患活動性と相関する遺伝子群とアバタセプトの影響2018
Author(s)
住友 秀次, 永渕 泰雄, 土田 優美, 土屋 遥香, 太田 峰人, 石垣 和慶, 神田 浩子, 立石 晶子, 鈴木 亜香里, 高地 雄太, 藤尾 圭志, 山本 一彦
Organizer
第4回日本骨免疫学会
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[Presentation] 関節リウマチ患者の末梢血CD4+T細胞亜分画のmodule解析2018
Author(s)
住友 秀次, 永渕 泰雄, 石垣 和慶, 土田 優美, 土屋 遥香, 太田 峰人, 花田 徳大, 神田 浩子, 立石 晶子, 鈴木 亜香里, 高地 雄太, 藤尾 圭志, 山本 一彦
Organizer
第22回リウマチフォーラム
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[Presentation] A Reduction in the Expression of CD83 on B Cells May Underlie the Genetic Predisposition for Rheumatoid Arthritis2018
Author(s)
Yumi Tsuchida, Shuji Sumitomo, Mineto Ota, Kazuyoshi Ishigaki, Kensuke Yamaguchi, Yasuo Nagafuchi, Haruka Tsuchiya, Hirofumi Shoda, Akari Suzuki, Kazuhiko Yamamoto, Yuta Kochi, Keishi Fujio
Organizer
第62回日本リウマチ学会
