エクソーム解析による熱性けいれん疾患感受性遺伝子の同定

2019 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 17K10079
• Research Institution: Ibaraki Prefectural University of Health Science
• Principal Investigator: 中山 純子 茨城県立医療大学, 公私立大学の部局等, 准教授 (30433155)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 野口 恵美子 筑波大学, 医学医療系, 教授 (40344882) ; 岩崎 信明 茨城県立医療大学, 保健医療学部, 教授 (70251006)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 熱性けいれん / 遺伝子 / エクソーム解析

Outline of Annual Research Achievements

次世代シークエンサーを使用してエクソーム解析を行うことにより、日本人熱性けいれん患者に共通な疾患遺伝子を同定することを目的として研究を継続した。
今年度は、研究代表者らが以前報告した熱性けいれんFEB4遺伝子座（5番染色体q14-q15領域）と連鎖する日本人熱性けいれん大家族（#K1家系）を対象として、前年度までにエクソーム解析で同定されたバリアントについて熱性けいれんとの関連について検討を行った。まず、FEB4遺伝子座に同定された機能変異が予測される33個のバリアントについて、本家系内の罹患者に共有されているかどうか解析を行った。それらの変異は本家系の熱性けいれんとは連鎖しておらず、疾患と関連している変異ではないと考えられた。
そのため、対象範囲を常染色体全体に拡大して解析を行った。全エクソームデータから同定された88683バリアントに対してフィルタリングを繰り返すことにより、現時点までに異なる２つの遺伝子上に候補バリアントが同定されている。そのうちの１つは、FEB4とは別の熱性けいれん遺伝子座に存在する遺伝子のバリアントであり、本家系の熱性けいれんの発症にかかわっている可能性が示唆されている。本家系以外の日本人熱性けいれん患者がこのバリアントを保有しているかどうか確認するために、331名の日本人熱性けいれん罹患者について解析を行った。TaqMan genotyping assayを用いた遺伝子型の解析では、いずれの患者も同バリアントは保有していなかった。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本年度までに、日本人熱性けいれん大家系のエクソーム解析により熱性けいれんの疾患感受性遺伝子の候補はみつかっているが、結果の確認のためにエクソーム解析をしていない家系内の非罹患者についてもエクソーム解析を行う必要が生じたため、次年度も研究を継続することとなったため。

Strategy for Future Research Activity

本年度までは、日本人熱性けいれん大家系の中の罹患者7名についてエクソーム解析を行い、非罹患者については解析を行っていなかった。そのため、今度は家系内の非罹患者についてもエクソーム解析を行い、結果をフィルタリングしなおして、熱性けいれんの発症にかかわるバリアントの同定をこころみる予定である。

Causes of Carryover

（理由）
研究代表者は筑波大学遺伝医学教室で研究を行っており、令和1年度は研究分担者である筑波大学遺伝医学教室の野口恵美子教授に分配した本研究費を使用して研究を行ったため。また、実験の追加が必要となり、本年度に予定していた学会での研究発表が行えなかったため。
（使用計画）
次年度使用額については、日本人熱性けいれん大家系の非罹患者の解析および、学会での研究発表のために使用する予定である。