2019 Fiscal Year Annual Research Report
The molecular pathogenenesis of pediatric acute lymphoblastic leukemia through the understanding of clonal artitectures
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17K10136
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| Research Institution | National Hospital Organization Nagoya Medical Center |
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Principal Investigator |
真田 昌 独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, 高度診断研究部長 (20529044)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 急性リンパ性白血病 / 遺伝子再構成 / クローン変化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
急性リンパ性白血病（ALL）の診療において、クローナルな免疫グロブリン（Ig）・T 細胞受容体（TCR）遺伝子の再構成の検出は微小残存病変（MRD）の評価などにおいて不可欠である。1歳以下に発症する乳児ALLは、難治例が多く、かつIg/TCR再構成を用いたMRD評価が困難であることが知られている。そこで、乳児ALLの臨床検体を対象に、昨年度までに確立したターゲットキャプチャーシーケンスを用いたIg/TCR再構成の同定を行った。乳児ALLはKMT2A（MLL)転座例が多く、MLL転座例とMLL野生型例に大別されるが、MLL野生型例に観察される再構成は、1歳以降に発症したB細胞性ALLと類似するものであったが、多くのMLL転座例では特徴的な再構成パターンが観察された。すなわち、MLL転座例においては、IGH以外の遺伝子に再構成が認められる症例は限られ、IGH再構成も完全なVDJ再構成ではなく、DJ再構成が多くの症例で認められ、MLL-AF4転座例で顕著であった。一方で、1歳以降に発症したB細胞性ALLに比して、1例あたり同定されるIGH再構成の数は多く、オリゴクローナルな病態が多いことが類推された。以上より、MLL転座例では、未分化な細胞を起源に、未分化な状態で腫瘍化していると考えられた。IGH再構成においては、再構成が生じるVDJ領域が、VH6-1やDH3-9など、限られた領域で生じていることも明らかとなった。限られた領域で再構成を起こしていることにより、従来のmultiplex-PCRに基づく再構成の同定が難しい理由となっていると推測される。ターゲットキャプチャーシーケンスの導入によりクローナルな再構成の検出率は大きく改善したが、オリゴクローナルな病態があることを考えると、Ig/TCR再構成に基づく、正確なMRD評価は難しい病態であることが推測された。
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[Journal Article] Genomic analysis of multiple myeloma using targeted capture sequencing in the Japanese cohort.2020
Author(s)
Kanamori T, Sanada M, Ri M, Ueno H, Nishijima D, Yasuda T, Tachita T, Narita T, Kusumoto S, Inagaki A, Ishihara R, Murakami Y, Kobayashi N, Shiozawa Y, Yoshida K, Nakagawa MM, Nannya Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Horibe K, Handa H, Ogawa S, Iida S.
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Journal Title
Br J Haematol.
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] DNA methylation-based classification reveals difference between pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia and normal thymocytes.2020
Author(s)
Kimura S, Seki M, Kawai T, Goto H, Yoshida K, Isobe T, Sekiguchi M, Watanabe K, Kubota Y, Nannya Y, Ueno H, Shiozawa Y, Suzuki H, Shiraishi Y, Ohki K, Kato M, Koh K, Kobayashi R, Deguchi T, Hashii Y, Imamura T, Sato A, Kiyokawa N, Manabe A, Sanada M, et. al.
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Journal Title
Leukemia
Volume: 34
Pages: 1163-1165
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Transcriptome analysis offers a comprehensive illustration of the genetic background of pediatric acute myeloid leukemia2019
Author(s)
Shiba N, Yoshida K, Hara Y, Yamato G, Shiraishi Y, Matsuo H, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kaburagi T, Takeuchi M, Ohki K, Sanada M, Okubo J, Tomizawa D, Taki T, Shimada A, Sotomatsu M, Horibe K, Taga T, Adachi S, Tawa A, Miyano S, Ogawa S, Hayashi Y.
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Journal Title
Blood Advances
Volume: 3
Pages: 3157-3169
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Frequent germline mutations of HAVCR2 in sporadic subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma.2019
Author(s)
Polprasert C, Takeuchi Y, Kakiuchi N, Yoshida K, Assanasen T, Sitthi W, Bunworasate U, Pirunsarn A, Wudhikarn K, Lawasut P, Uaprasert N, Kongkiatkamon S, Moonla C, Sanada M, Akita N, Takeda J, Fujii Y, Suzuki H, Nannya Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Rojnuckarin P, Ogawa S, Makishima H.
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Journal Title
Blood Advances
Volume: 3
Pages: 588-595
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Frequent structural variations involving programmed death ligands in Epstein-Barr virus-associated lymphomas.2019
Author(s)
Kataoka K, Miyoshi H, Sakata S, Dobashi A, Couronn L, Kogure Y, Sato Y, Nishida K, Gion Y, Shiraishi Y, Tanaka H, Chiba K, Watatani Y, Kakiuchi N, Shiozawa Y, Yoshizato T, Yoshida K, Makishima H, Sanada M, et al.
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Journal Title
Leukemia
Volume: 33
Pages: 1687-1699
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Genetic and transcriptional landscape of plasma cells in POEMS syndrome.2019
Author(s)
Nagao Y, Mimura N, Takeda J, Yoshida K, Shiozawa Y, Oshima M, Aoyama K, Saraya A, Koide S, Rizq O, Hasegawa Y, Shiraishi Y, Nishijima D, Isshiki Y, Kayamori K, Kawajiri C, Oshima N, Tsukamoto S, Mitsukawa S, Takeda Y, Ohwada C, Takeuchi M, Iseki T, Misawa S, Miyano S, Ohara O, Yokote K, Sakaida E, Sanada M, et al.
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Journal Title
Leukemia
Volume: 33
Pages: 1723-1735
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Comprehensive genetic analysis of multiple myeloma in Japan.2019
Author(s)
Kanamori T, Sanada M, Ri M, Ueno H, Nishijima D, Yasuda T, Aoki S, Asano A, Tachita T, Kinoshita S, Narita T, Ito A, Kusumoto S, Masuda Y, Kobayashi N, Shiozawa Y, Nakagawa M, Nannya Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Komatsu H, Miyano S, Handa H, Ogawa S, Iida S.
Organizer
24th Congress of the European Hematology Association
Int'l Joint Research
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[Presentation] Multicentre standardization of minimal residual disease detection and quantitation using the euroclonality-NGS assay.2019
Author(s)
Svaton M, Fronkova E, Reigl T, Caye A, Bie M, Genuardi E, Jelinkova H, Lim E, Nishijima D, Pal K, Salemi D, Sarasquete M, Songia S, Tosi M, Villarese P, Wakeman S, Cave H, Cazzaniga G, Frrero S, Sanz RG, Hancock J, Macintyre E, Plevova K, Sanada M, et al.
Organizer
24th Congress of the European Hematology Association
Int'l Joint Research
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