2018 Fiscal Year Research-status Report
性同一性障害当事者の全ゲノムシーケンス解析によるバイオマーカー開発の基盤構築
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17K10283
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
仲地 ゆたか 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 助教 (10522097)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
金沢 徹文 大阪医科大学, 医学部, 講師 (20534100)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 全ゲノム解析 / 性同一性障害 / 性別違和 / 性ステロイドホルモン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
当該年度では研究体制の大幅な変更があったものの、最新の全ゲノム解析パイプライン構築と候補遺伝子の検証系準備に一定の進捗を得た。前年度から引き続き解析環境のアップデート（hg38/GRCh38及びJRGv2対応など）をおこなってきたが、拡張著しい公共データベースや変異データベースなどに逐次対応することで、全ゲノム解析および大規模オミクックスデータとの統合解析をより詳細におこなえるようになった。また2次解析として性ステロイドホルモン受容体などの転写調節因子の認識配列解析などのバイオインフォマティクス解析も進めてきたが、in silicoだけではなくin vitro、とくに神経芽細胞などの株化細胞をもちいた遺伝子導入実験により候補遺伝子検証系を当該年度で準備することができた。マーカー蛋白と融合させた候補遺伝子由来産物の核内移行の確認や安定発現株の作成による発現解析などを用いた候補遺伝子の検証を現在進めており、これまでの全ゲノム解析で抽出されてきた候補遺伝子などについて順次検証実験をおこなっている。そのため次年度以降は新規のGID当事者サンプルの確保も追求しつつ、既存のシーケンスデータも含めて解析を進めるほか、性ステロイドホルモン受容体による転写調節にも着目したGID機序を考察がしていく予定である。現在までの進捗は第41回日本分子生物学会年会（2018年11月30日・横浜）にてポスター発表、およびGID（性同一性障害）学会第21回研究大会（2019年3月23日・岡山）にて口頭発表をおこなっている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
前年度での法令改正への対応などにより、予想外の計画の遅れが避けられない状況であったが、当該年度においても研究体制自体を大幅に変更することになった。研究代表者・連携協力者の異動とそれにともなう利用機器の変更・縮小に加え、研究体制変更による倫理再申請などがあらたに必要となっている。そのため研究計画の遂行がおおきく制限されたことで進捗に遅れが生じている。当該年度に開始を計画していた検証実験（アゴニスト・阻害剤投与モデル動物や培養細胞をもちいた解析）を大幅に変更する必要があったものの、培養細胞をもちいた候補遺伝子の検証系構築では一定の成果を得ることができた。またGID当事者サンプル数を増やすことはできなかったが、最新の解析ツールとデータベース導入により解析パイプライン構築が完了したことと候補遺伝子の抽出自体が進展したこともあり、一定の進捗をみることができた。懸念された計画自体の大幅な方向転換を会費することができたことから、次年度はさらにあらたな進捗を得るべく研究を促進する予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は既存サンプルも含めた最新環境での全ゲノム解析および2次解析をあたらしい研究体制の中で進めつつ、可能なかぎり新規GID当事者サンプルも追求する。また抽出されてきた候補遺伝子について、培養細胞などをもちいた機能解析などの検証も併行して進める。とくに前年度からマウスの遺伝子発現データとの統合が課題であることから、今後も脳の性分化に関する時系列発現データの採取と統合をすすめていく予定である。
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| Causes of Carryover |
全ゲノム解析分としてその他経費を計上しているため、GID当事者の新規サンプルが得られなかったことによりあらたな全ゲノム解析がおこなえなかったことが、次年度使用額として大きな金額が生じた原因となっている。GID当事者の新規サンプル追求を目指すとともに、インデックスホッピング問題への対応で再解析が必要な既存サンプルについても順次再解析をおこなう予定である。
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Research Products
(2 results)
