Expression analysis of miR based on miR-106b-25 cluster

2019 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17K10616
• Research Institution: Chiba Cancer Center (Research Institute)
• Principal Investigator: 星野 敢 千葉県がんセンター(研究所), 消化器外科, 主任医長 (10400904)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: microRNA / miR-106b / microRNA-106b-25 cluster / MCM7 / 食道扁平上皮癌 / miR-1246

Outline of Annual Research Achievements

microRNA（以下、miRNA）が癌の発生・進展に密接に関与することが報告されている。今回、食道扁平上皮癌患者におけるmicroRNA-106b-25 clusterの動態また、それらの患者血液中での発現解析ならびに新規バイオマーカーとしての有効性の検証を行うことを目的とした。microRNA-106b-25の、miR-106b、93、25について千葉大学での患者血清サンプル55検体(健常コントロール39検体）をtest cohort、千葉県がんセンターでの患者血清サンプル101検体（健常コントロール34検体）をvalidatioin cohortとした。real time PCRでの解析の結果、いずれのcohortにおいてもmiR-106bの発現のみ健常者血清に比較し有意に発現が低値であることが確認された。また、食道癌組織検体30例を用いて正常部および癌部での発現を確認したところいずれのmiRの発現も癌部、正常部で有意な発現の差を認めなかった。一方で、microRNA-106b-25 clusterの配列を有するhost geneであるMCM7(mini-chromosome maintenance 7)遺伝子は癌部での発現が有意に高かった。また組織検体でのCNVの解析においても癌部、正常部でMCM7遺伝子に差を認めなかった。またこれら血清中のmiR存在のメカニズムとしてexsomeを介した能動的な分泌機構の関与が示唆されたため、血清中におけるexsome画分と、totalでのそれぞれのmiRの発現を確認するも、有意な差を認めず、exsomeの関与は大きくないものと考えられた。報告済みである食道扁平上皮癌患者血清中で発現が上昇すると考えられるmiR-1246と今回検討したmiR106bのratioでの解析では個別での感度、特異度より良好である傾向を認めた。

Research Products

• [Journal Article] Radiogenomics predicts the expression of microRNA-1246 in the serum of esophageal cancer patients. (2020)
  • Author(s): Hoshino I, Yokota H, Ishige F, Iwatate Y, Takeshita N, Nagase H, Uno T, Matsubara H.
  • Journal Title: Sci Rep. Volume: 10 Pages: N/A
  • DOI: 10.1038/s41598-020-59500-7.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Prognostic significance of p16 protein in pancreatic ductal adenocarcinoma (2020)
  • Author(s): Iwatate Y, Hoshino I, Ishige F, Itami M, Chiba S, Arimitsu H, Yanagibashi H, Nagase H, Yokota H, Takayama W.
  • Journal Title: Mol Clin Oncol. Volume: N/A Pages: N/A
  • DOI: 10.3892/mco.2020.2047
• [Journal Article] Prognostic impact of p53 and/or NY‐ESO‐1 autoantibody induction in patients with gastroenterological cancers (2020)
  • Author(s): Hoshino I, Nabeya Y, Takiguchi N, Gunji H, Ishige F, Iwatate Y, Shiratori F, Yajima S, Okada R, Shimada H
  • Journal Title: Ann Gastroenterol Surg. Volume: N/A Pages: N/A
  • DOI: 10.1002/ags3.12325
  • Open Access
• [Journal Article] Genome-wide ChIP-seq data with a transcriptome analysis reveals the groups of genes regulated by histone demethylase LSD1 inhibition in esophageal squamous cell carcinoma cells. (2019)
  • Author(s): Hoshino I, Takahashi M, Akutsu Y, Murakami K, Matsumoto Y, Suito H, Sekino N, Komatsu A, Iida K, Suzuki T, Inoue I, Ishige F, Iwatate Y, Matsubara H.
  • Journal Title: Oncol Lett. Volume: 18 Pages: 872-881
  • DOI: 10.3892/ol.2019.10350.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Radiogenomicsは、食道癌患者の血清中のマイクロRNA-1246の発現を予測する (2019)
  • Author(s): 星野 敢, 横田 元, 石毛 文隆, 岩立 陽祐, 竹下 修由, 滝口 伸浩, 池田 篤, 早田 浩明, 外岡 亨, 郡司 久, 永瀬 浩喜, 鍋谷 圭宏, 松原 久裕
  • Organizer: 第119回日本外科学会定期学術集会
• [Presentation] ラジオゲノミクスを用いたゲノム医療の可能性 (2019)
  • Author(s): 星野 敢, 横田 元, 岩立 陽佑, 石毛 文隆, 郡司 久, 滝口 伸浩, 池田 篤, 早田 浩明, 外岡 亨, 鍋谷 圭宏
  • Organizer: 第73回日本食道学会学術集会
• [Presentation] 難治性消化器癌における、異なる体液サンプルを用いたcell-free microRNAの検討 (2019)
  • Author(s): 星野 敢, 石毛 文隆, 岩立 陽佑, 滝口 伸浩, 池田 篤, 早田 浩明, 外岡 亨, 郡司 久, 川原 健治, 鍋谷 圭宏
  • Organizer: 第74回日本消化器外科学会総会
• [Presentation] トランスレーショナルリサーチについて考える:臨床現場のアイデアをどう生かすか 画像検査からゲノムを読み解く Rasiogenomicsの臨床応用の可能性 (2019)
  • Author(s): 星野 敢, 石毛 文隆, 岩立 陽佑, 郡司 久, 滝口 伸浩, 池田 篤, 早田 浩明, 外岡 亨, 白鳥 史明, 田部 俊輔, 鍋谷 圭宏
  • Organizer: 第81回日本臨床外科学会総会
• [Presentation] ラジオゲノミクスは食道癌患者の血清中のマイクロRNAの発現を予測する(Radiogenomics predicts the expression of microRNA in the serum of esophageal cancer patients) (2019)
  • Author(s): 星野 敢, 横田 元, 岩立 陽祐, 石毛 文隆, 鍋谷 圭宏, 筆宝 義隆, 永瀬 浩喜, 松原 久裕
  • Organizer: 第78回 日本癌学会総会