• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Establishment of the method to identify the ulcerative colitis patients with high risk of colorectal cancer

Research Project

Project/Area Number 17K10628
Research InstitutionMie University

Principal Investigator

問山 裕二  三重大学, 医学系研究科, 准教授 (00422824)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井上 靖浩  三重大学, 医学系研究科, 客員准教授 (20324535)
楠 正人  三重大学, 医学系研究科, 教授 (50192026)
荒木 俊光  三重大学, 医学系研究科, 准教授 (70343217)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords潰瘍性大腸炎 / 大腸癌 / DNAメチル化
Outline of Annual Research Achievements

背景:潰瘍性大腸炎関連大腸癌(UCAC)は“Dysplasia-Carcinoma Sequence”による発癌過程を呈し,慢性炎症長期化が粘膜のAgingを促進し,UCAC発症リスクになると考えられている。
目的:今回、正診率の高い診断マーカーを検討する為に、潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜の網羅的DNAメチル化解析を施行した。
方法:コホート1:UCAC合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜(n=24)とUCAC非合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜(n=24)からDNAを抽出し、Illumina HumanMethylation450k BeadChip Arrayを用いて、全ゲノムのメチル化プロファイルを行った。ChAMP algorithmを用いて、UCAC合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜で有意に異なる2,549のメチル化領域(differentially methylated regions:DMRs)を同定した。さらに|Δβ| > 0.1のものを選択することで、484DMRsに絞り込めた。さらに生物学的意義のある集団として機能するものが選択できるEnrichment Analysisを施行することで、180DMRsに絞り込めた。最後に100回のLogistic regression analysisを施行し、11DMRsを選択した。直腸粘膜における11DMRsを用いたUCAC合併潰瘍性大腸炎患者診断能は、ROC解析によると、AUCが0.96であった。コホート2:UCAC合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜(n=8)とUCAC非合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜(n=8)を用いた再検証試験では、AUCが0.81であった。
結語:網羅的DNAメチル化解析により11DMRsを選択できた。これらのマーカーはUCAC合併する潰瘍性大腸炎患者を選択できることが示唆され、今後の前向試験を検討している。

  • Research Products

    (5 results)

All 2019

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Inflammation-Associated Microsatellite Alterations Caused by MSH3 Dysfunction Are Prevalent in Ulcerative Colitis and Increase With Neoplastic Advancement.2019

    • Author(s)
      Munakata K, Koi M, Kitajima T, Tseng-Rogenski S, Uemura M, Matsuno H, Kawai K, Sekido Y, Mizushima T, Toiyama Y, Yamada T, Mano M, Mita E, Kusunoki M, Mori M, Carethers JM.
    • Journal Title

      Clin Transl Gastroenterol.

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.14309/ctg.0000000000000105.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 小児潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜におけるmicroRNA-124メチル化の意義2019

    • Author(s)
      小池 勇樹, 問山 裕二, 奥川 喜永, 長野 由佳, 松下 航平, 大北 喜基, 井上 幹大, 荒木 俊光, 内田 恵一, 楠 正人
    • Organizer
      日本外科学会
  • [Presentation] 網羅的DNAメチル化解析から抽出した潰瘍性大腸炎合併大腸癌診断マーカー2019

    • Author(s)
      問山 裕二, 山本 晃, 奥川 喜永, 楠 蔵人, 大村 悠介, 藤川 裕之, 大北 喜基, 廣 純一郎, 大井 正貴, 楠 正人
    • Organizer
      日本消化器外科学
  • [Presentation] 網羅的メチル化解析から抽出したOPLAHメチル化異常の潰瘍性大腸炎における臨床的意義2019

    • Author(s)
      問山 裕二, 山本 晃, 奥川 喜永, 楠 蔵人, 楠 由紀奈, 大村 悠介, 市川 崇, 井出 正造, 志村 匡信, 北嶋 貴仁, 藤川 裕之, 安田 裕 美, 大北 喜基, 横江 毅, 廣 純一郎, 大井 正貴, 荒木 俊光, 内田 恵一, 楠 正人
    • Organizer
      日本大腸肛門病学会
  • [Book] 大腸がんperspective2019

    • Author(s)
      問山 裕二, 楠 正人
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      メディカルレビュー社

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi