2019 Fiscal Year Annual Research Report
Establishment of the method to identify the ulcerative colitis patients with high risk of colorectal cancer
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17K10628
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| Research Institution | Mie University |
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Principal Investigator |
問山 裕二 三重大学, 医学系研究科, 准教授 (00422824)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井上 靖浩 三重大学, 医学系研究科, 客員准教授 (20324535)
楠 正人 三重大学, 医学系研究科, 教授 (50192026)
荒木 俊光 三重大学, 医学系研究科, 准教授 (70343217)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 潰瘍性大腸炎 / 大腸癌 / DNAメチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
背景：潰瘍性大腸炎関連大腸癌(UCAC)は“Dysplasia-Carcinoma Sequence”による発癌過程を呈し，慢性炎症長期化が粘膜のAgingを促進し，UCAC発症リスクになると考えられている。
目的：今回、正診率の高い診断マーカーを検討する為に、潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜の網羅的DNAメチル化解析を施行した。
方法：コホート1：UCAC合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜（n=24)とUCAC非合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜（n=24)からDNAを抽出し、Illumina HumanMethylation450k BeadChip Arrayを用いて、全ゲノムのメチル化プロファイルを行った。ChAMP algorithmを用いて、UCAC合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜で有意に異なる2,549のメチル化領域(differentially methylated regions:DMRs)を同定した。さらに|Δβ| > 0.1のものを選択することで、484DMRsに絞り込めた。さらに生物学的意義のある集団として機能するものが選択できるEnrichment Analysisを施行することで、180DMRsに絞り込めた。最後に100回のLogistic regression analysisを施行し、11DMRsを選択した。直腸粘膜における11DMRｓを用いたUCAC合併潰瘍性大腸炎患者診断能は、ROC解析によると、AUCが0.96であった。コホート2：UCAC合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜（n=8)とUCAC非合併潰瘍性大腸炎患者の直腸粘膜（n=8)を用いた再検証試験では、AUCが0.81であった。
結語：網羅的DNAメチル化解析により11DMRｓを選択できた。これらのマーカーはUCAC合併する潰瘍性大腸炎患者を選択できることが示唆され、今後の前向試験を検討している。
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Research Products
(5 results)
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[Journal Article] Inflammation-Associated Microsatellite Alterations Caused by MSH3 Dysfunction Are Prevalent in Ulcerative Colitis and Increase With Neoplastic Advancement.2019
Author(s)
Munakata K, Koi M, Kitajima T, Tseng-Rogenski S, Uemura M, Matsuno H, Kawai K, Sekido Y, Mizushima T, Toiyama Y, Yamada T, Mano M, Mita E, Kusunoki M, Mori M, Carethers JM.
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Journal Title
Clin Transl Gastroenterol.
Volume: 10
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] 網羅的メチル化解析から抽出したOPLAHメチル化異常の潰瘍性大腸炎における臨床的意義2019
Author(s)
問山 裕二, 山本 晃, 奥川 喜永, 楠 蔵人, 楠 由紀奈, 大村 悠介, 市川 崇, 井出 正造, 志村 匡信, 北嶋 貴仁, 藤川 裕之, 安田 裕 美, 大北 喜基, 横江 毅, 廣 純一郎, 大井 正貴, 荒木 俊光, 内田 恵一, 楠 正人
Organizer
日本大腸肛門病学会
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