2021 Fiscal Year Research-status Report
Identification of biomaker for predicting liver metastasis of colorectal cancer with CAGE analysis
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17K10652
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| Research Institution | Juntendo University |
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Principal Investigator |
小見山 博光 順天堂大学, 医学部, 非常勤講師 (30348982)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
加藤 俊介 順天堂大学, 大学院医学研究科, 教授 (40312657)
茂櫛 薫 順天堂大学, 大学院医学研究科, 非常勤講師 (60569292)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 大腸癌 / 癌遺伝子 / バイオマーカー / 肝転移 / 転移予測マーカー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、次世代シークエンサー（NGS）を用いて大腸癌リンパ節転移、肝転移に関与する遺伝子を突き止め、既存の診断法、治療法よりも精度の高い医療、臨床応用を確立することを目的とする。近年、遺伝子の転写開始点を網羅的に解析するCAGE法（capanalysis of gene expression法）が開発された。そしてこの極めて定量性の高いCAGE法により、ヒトの18万を超える転写開始点とそれに由来する転写産物の発現量の網羅的解析が行われた。我々はこのCAGE法などを用い、肝転移を伴う症例も含め、大腸がん症例を対象にてがん組織発現の網羅的解析に取り組んできた。さらに症例の追跡調査を行い、予後、再発などの新たな臨床 データを取得し、肝転移群特異的マーカー候補遺伝子群から絞り込む解析を行っている。この再解析を行うことによって得られた新たな遺伝子群に関して文献調査を含め検討を行っている。肝転移マーカー候補の取得を目指し、MA-plotによる候補遺伝子の同定だけでなく、GO解析、パスウェイ解析など、大腸がんの肝転移に関与するシグナルカスケードの評価を多角的に取り組んでいる。検証の過程において必要であれば、追加の解析を行い、検証データを取得し、肝転移マーカの絞り込みを行っていく。本研究の結果、大腸癌患者の術前内視鏡検査において、早期に肝転移を検出するシステムを確立することが可能になれば、これまでにない治療効果が期待できる。また、術前化学療法の適応にも影響を及ぼすことが期待され、現在の臨床医療に対して貢献できると考える。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
新型コロナ感染拡大によって研究協力・材料調達に影響があり、工程の遅れが発生した。一方、すでに大腸癌において特異的発現を示す遺伝子群を特定し、さらに肝転移特異的なマーカー候補遺伝子などを選抜し た。この点で当初目的とした成果を得ている。研究の進展により、遺伝子の群分けの変更が有用であることが明らかになった。肝転移症例の再発の有無なども含めた臨床情報を含め、CAGE解析の群分けを再度行い、さらに新たな手法も用いて解析を進めてきた。しかしながら当初計画からの遅れを取り戻しているとは言えない。以上を考え併せ、上記の状況評価とした。
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| Strategy for Future Research Activity |
肝転移症例の再発の有無なども含めた臨床情報を更新し、CAGE解析による遺伝子の群分けを再度行った。この新規な群分けによって肝転移マーカーとして有効な新規遺伝子の絞り込みを進めてきた。
2022年度はこれまでに候補遺伝子群から選抜した候補遺伝子について、肝転移マーカーとしての有用性評価を進める。特に取得データと、各種データーベースの対照による解析、なた新規検体を用いたNGS解析、デジタルPCR解析などを追加し、候補マーカーの有用性検証を行っていく。
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| Causes of Carryover |
大腸癌肝転移に関与する遺伝子の特定、高精度の診断法確立を目標とし研究を行ってきた。CAGE解析結果から再度遺伝子の群分けを行ったのち、これに基づいて新規に遺伝子データーの解析を進めている。しかし研究工程については新型コロナ感染拡大状況の影響を受け、様々な局面で研究の遅延が発生している。この状況下では困難であったため想定していたアルバイトの雇用も行っていない。また研究棟の移転と実験室の再移動の影響によって、一部の研究資材の購入を延期した。以上の事情から、次年度使用額が発生した。
2022年度には患者検体における遺伝子・遺伝子発現の解析を行うためにこの資金を使用する。
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Research Products
(3 results)
