2017 Fiscal Year Research-status Report
Genetic analysis of spinal cord glioma and identification of novel therapeutic targets
Project/Area Number |
17K10857
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
田中 將太 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (80643725)
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Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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Keywords | 脊髄グリオーマ / 正中グリオーマ / H3 K27M変異 / H3F3A |
Outline of Annual Research Achievements |
小児のびまん性橋グリオーマに代表される正中に発生するグリオーマを特徴づける遺伝子異常は、ヒストンH3をコードする遺伝子の変異である。脊髄グリオーマにも同遺伝子変異が見られるが、疾患の希少性と検体の微量性から、その遺伝子解析研究は数少ない。そこで本研究では、多施設共同研究の形で比較的大規模なコホートを構築し、遺伝子プロファイルを明らかにすることで、治療の最適化・新規治療の開発を目指す。 獨協医科大学病院・都立神経病院・東京大学医学部附属病院にてに治療された脊髄グリオーマ(星細胞系腫瘍)を後方視的に収集した。2000年~2016年に治療され解析可能な32症例を対象として遺伝子解析を行い、臨床情報との統合解析を行った。年齢は1歳~84歳と広く分布し、中央値は43歳であった。発生部位は頚髄が最多であったが、腰髄・仙髄にも見られた。病理診断は高悪性度が19例、低悪性度が13例であった。免疫染色にてH3 K27M変異は9例(28%)に見られた。生存解析にて、H3 K27M変異のある症例は予後が不良である傾向があった。以上より、脊髄グリオーマにおいてH3 K27M変異は高頻度に見られ、陽性症例の臨床像は年齢・発生部位とも多彩であること、H3 K27Mは予後不良因子である可能性があること、が分かった。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
各施設で作成された症例リストから、解析に足る検体が得られる症例を抽出し、匿名化したうえで収集するのに想定以上の時間を要し、約3か月の遅れを生じた。 また、後方視的に収集した検体の多くはパラフィン検体であり、微小な検体の未染スライド数枚からDNAを抽出するのは非常に困難と予想された。さらに古い検体のDNAクオリティーにも懸念があるため、その技術の安定性の確立に若干時間を要し、約1か月の遅れを生じた。
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Strategy for Future Research Activity |
免疫組織染色の結果とサンガーシークエンスの結果に乖離が見られた症例が複数見られたので、その検証を行うとともに、コホートを拡大して臨床情報との統合解析を行う。また、過去の検体を用いてターゲットシークエンスを行い、H3F3A・HIST1H3B以外の遺伝子変異の検索を計画中である。 併行して、凍結検体・ペア血液検体が揃う症例の収集を継続しているので、解析に足る症例数が得られた段階で、全エクソーム解析など網羅的解析を行う予定である。
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Causes of Carryover |
前述の通り研究に遅延が生じ、DNA収集と解析を行えていない検体が複数存在する。次年度は、各施設からさらに症例を収集するとともに、未解析の検体の遺伝子解析を行っていく予定である。さらに次年度には、予算の大きな消費が予想されるターゲットシークエンスや全エクソーム解析を計画している。
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Research Products
(4 results)
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[Presentation] Unveiling diffuse midline glioma, H3 K27M-mutant in the spinal cord2017
Author(s)
Shota Tanaka, Ryohei Otani, Hirotaka Hongo, Hazuki Matsuda, Akitake Mukasa, Keisuke Ueki, Takashi Komori, Makoto Taniguchi, Nobuhito Saito, Phyo Kim
Organizer
第35回日本脳腫瘍病理学会
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[Presentation] Clinical and genetic characteristics of diffuse midline glioma in the spinal cord2017
Author(s)
Shota Tanaka, Ryohei Otani, Hirotaka Hongo, Hazuki Matsuda, Masako Ikemura, Masashi Nomura, Shunsaku Takayanagi, Takahide Nejo, Satoshi Takahashi, Yosuke Kitagawa, Taijun Hana, Akitake Mukasa, Keisuke Ueki, Takashi Komori, Makoto Taniguchi, Nobuhito Saito, and Phyo Kim
Organizer
22ND ANNUAL SCIENTIFIC MEETING OF THE SOCIETY FOR NEURO-ONCOLOGY
Int'l Joint Research
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[Presentation] 脊髄グリオーマにおけるH3 K27M変異の臨床的意義2017
Author(s)
Shota Tanaka, Ryohei Otani, Hirotaka Hongo, Hazuki Matsuda, Masako Ikemura, Masashi Nomura, Shunsaku Takayanagi, Takahide Nejo, Satoshi Takahashi, Yosuke Kitagawa, Taijun Hana, Akitake Mukasa, Keisuke Ueki, Takashi Komori, Makoto Taniguchi, Nobuhito Saito, and Phyo Kim
Organizer
第35回日本脳腫瘍学会学術集会