Exploration of novel pathogens for prostate cancer

2020 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17K11143
• Research Institution: Kochi University
• Principal Investigator: 蘆田 真吾 高知大学, 教育研究部医療学系臨床医学部門, 講師 (80380327)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中川 英刀 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (50361621)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 前立腺癌 / 病原体

Outline of Annual Research Achievements

我々は、これまでに、前立腺癌患者20例の組織サンプルを用いてRNA-seq解析を行い、pathogen候補として4つの細菌を同定した。同定されたpathogen候補のうち、細菌Aは、これまでにも前立腺癌組織への感染の報告があるが、今回の検討の結果で確証が得られたと考えられた。細菌B、C、Dについては、これまでに全く報告がなく、新たな前立腺癌のpathogenとして期待が持てると考えられた。そして、それぞれについて免疫組織染色あるいはPCRによってバリデーションを行った。細菌Aに関しては、モノクロナール抗体を用いて免疫組織染色を行ったところ、20例中19例の前立腺癌組織において細菌Aを検出できた。
我々は、細菌Aを有力候補として、まず、発癌機序の解明を行うため、前立腺正常上皮細胞に細菌Aを感染させ、24時間、48時間、2週間後にRNAを抽出し、マイクロアレイ解析を行った。マイクロアレイ解析の結果、細菌Aを感染させた細胞において、発癌に重要な役割を果たす遺伝子群の遺伝子発現低下を認めた。そこで、これら遺伝子群の遺伝子発現低下の機序について研究を進めた。まず、epigeneticな要因としてメチル化の有無について調べた。Methylation specific PCR法を用いて、これら遺伝子群のメチル化の有無を調べたところ、メチル化は認めなかった。次に、細菌Aが、これら遺伝子群のプロモーター活性に影響を与えるかどうかについて調べるため、これら遺伝子群のプロモーター領域をクローニングし、現在、プロモーターアッセイを行っている。