2018 Fiscal Year Research-status Report
Omics-based analysis of specific biomarkers for leiomyosarcoma
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17K11281
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Research Institution | National Hospital Organization, Kyushu Cancer Center |
Principal Investigator |
園田 顕三 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 医長 (30294929)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中林 一彦 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 周産期病態研究部, 室長 (10415557)
秦 健一郎 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 周産期病態研究部, 部長 (60360335)
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Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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Keywords | 子宮平滑筋肉腫 / 染色体微細構造解析 / DNAメチル化解析 / 遺伝子発現解析 / 次世代シーケンサー |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、術前診断における子宮平滑筋腫との鑑別が困難で、悪性度が高く治療方針に苦慮する子宮平滑筋肉腫および類縁疾患を解析対象としました。染色体構造解析、DNAメチル化解析、遺伝子発現解析等により構成されるOMICS解析から子宮平滑筋肉腫に特異的なバイオマーカーの抽出を試み、早期診断と効果的治療法に帰結させることを本研究の目的とし推進してきました。早期診断および標的治療に有用なバイオマーカーを抽出し子宮平滑筋肉腫の治療成績を向上させると伴に、本研究手法をさらに発展させ他悪性腫瘍の早期診断・治療成績向上に帰結させることを究極の目的として進捗させています。 「現在までの進捗状況」に詳述しますが、研究開始2年目である平成30年度では(1)子宮平滑筋肉腫の検体を用いたOMICS解析と(2)子宮平滑筋肉腫の特異的バイオマーカー検索につき進捗させました。(1)は子宮平滑筋正常細胞から悪性細胞に至る悪性化の経路について解析を行う目的で施行しています。(2)は(1)で得られたデータの中で、次世代シークエンサーによるRNAseq解析で正常子宮筋層・平滑筋腫と平滑筋肉腫での発現が有意に異なる分子を選別しました。正常子宮筋層・平滑筋腫での発現が平滑筋肉腫に比し有意に高値である12分子、平滑筋肉腫での発現が正常子宮筋層・平滑筋腫に比し有意に高値である8分子を選別しました。これらの分子のタンパク発現については、別途免疫組織染色により解析中です。平成30年度には、研究進捗に基づき医学誌・学会等で成果の発表を行ってきました。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
(1)子宮平滑筋肉腫の検体を用いたOMICS解析:子宮平滑筋正常細胞から悪性細胞に至る悪性化の経路について解析を行う目的で、子宮平滑筋肉腫の検体から抽出したRNAからRNAシークエンス用のライブラリーを作製し、次世代シークエンサーで網羅的解析を施行しました。得られた遺伝子発現情報とDNAメチル化情報を比較し、最終的には各組織型に特異的なmolecular signatureを同定する作業を行っています。これらの分子生物学的解析によって得られたデータを用いて、腫瘍の臨床病理因子・予後との相関について統計学的解析を行う予定です。この解析により得られる各腫瘍のmolecular signatureは細胞生物学的特性に関して理解可能となるのみならず、細胞同定による検査法や標的治療法の確立へ帰結することが期待できます。 (2)子宮平滑筋肉腫の特異的バイオマーカー検索:以前、正常子宮筋層・平滑筋腫・平滑筋肉腫:各3症例と平滑筋肉腫細胞株:3種を使用して網羅的アレイを用いた遺伝子発現解析を行いました。平滑筋肉腫での発現が正常子宮筋層・平滑筋腫に比し有意に高値である群には細胞周期関連分子が、逆に平滑筋肉腫で低発現である群には細胞接着分子が含まれることを報告しました(Miyata T, Sonoda K et al. Sarcoma 412068, 2015)。今回は平滑筋肉腫症例サンプルを更に9症例増やして次世代シークエンサーによるRNAseq解析で正常子宮筋層・平滑筋腫と平滑筋肉腫での発現が有意に異なる分子を選別しました。正常子宮筋層・平滑筋腫での発現が平滑筋肉腫に比し有意に高値である12分子、平滑筋肉腫での発現が正常子宮筋層・平滑筋腫に比し有意に高値である8分子のタンパク発現については、免疫組織染色により解析中です。
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Strategy for Future Research Activity |
(1)候補分子の発現を人為的に変化させた際の細胞特性の解析:molecular signature解析により得られた細胞特性を表現するバイオマーカーの発現を人為的に変化させた細胞株(強制発現またはRNA干渉による発現ノックダウン)を用いた発現分子プロファイルの変化、細胞増殖、細胞遊走能・浸潤能等に関してin vitro解析を行います。また、これらの細胞株をヌードマウス皮下等に移植しin vivo造腫瘍能を解析します。 (2)候補分子による診断能の検証:前述したように、子宮平滑筋肉腫は平滑筋腫との術前における鑑別は極めて困難です。本研究で得られた特異的バイオマーカーの発現について、細胞診・組織診検体を用いて解析を行います。さらに、本研究では末梢血細胞も検体として解析を行います。検出法としては、樹脂マイクロ流体チップを用いて細胞を分離・回収した後のpolymerase chain reaction(PCR)法、特異的抗体での細胞染色およびflow cytometry解析等が考慮されます。 (3)候補分子をターゲットとした標的治療の構築:特異的バイオマーカーをターゲットとした分子標的治療法としては、複数が候補として考慮されます。即ち、①特異的抗体の作製、②化合物アレイを使用したsmall substance同定、③RNA干渉による発現ノックダウン等が考慮されます。RNA干渉システム使用時には効率良い組織デリバリーおよび発現システムの開発を併せ試みます。
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[Journal Article] Infertility after abdominal trachelectomy.2018
Author(s)
Katsuko Egashira, Kana Hiasa, Natsuko Yokota, Teruhiko Kawamura, Chihiro Minami, Kaoru Okugawa, Hideaki Yahata, Kenzo Sonoda, Kiyoko Kato.
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Journal Title
Acta Obstetricia et Gynecologica Scandinavica
Volume: 97
Pages: 1358~1364
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Prognostic outcome and complications of sentinel lymph node navigation surgery for early-stage cervical cancer.2018
Author(s)
Hideaki Yahata, Hiroaki Kobayashi, Kenzo Sonoda, Keisuke Kodama, Hiroshi Yagi, Masafumi Yasunaga, Tatsuhiro Ohgami, Ichiro Onoyama, Eisuke Kaneki, Kaoru Okugawa, Shingo Baba, Takuro Isoda, Yoshihiro Ohishi, Yoshinao Oda, Kiyoko Kato.
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Journal Title
International Journal of Clinical Oncology
Volume: 23
Pages: 1167~1172
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Two types of small cell carcinoma of the ovary: Two typical case reports.2018
Author(s)
Yu Yoshida, Eisuke Kaneki, Masako Kijima, Keisuke Kodama, Shinichiro Yamaguchi, Hiroshi Yagi, Masafumi Yasunaga, Tatsuhiro Ohgami, Ichiro Onoyama, Hideaki Yahata, Kenzo Sonoda, Kiyoko Kato.
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Journal Title
Gynecologic Oncology Reports
Volume: 25
Pages: 125~130
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Amide proton transfer (APT) imaging of benign ovarian cystic lesions.2018
Author(s)
Keisuke Ishimatsu, Akihiro Nishie, Yukihisa Takayama, Yoshiki Asayama, Kousei Ishigami, Yasuhiro Ushijima, Daisuke Kakihara, Nobuhiro Fujita, Koichiro Morita, Seiichiro Takao, Osamu Togao, Kenzo Sonoda, Jochen Keupp, Hiroshi Honda.
Organizer
Joint Annual Meeting ISMRM-ESMRMB 2018
Int'l Joint Research
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[Presentation] Retrospective analysis on clinicopathological variables and prognosis of patients diagnosed as cervical cancer within 6 months after parturition.2018
Author(s)
Kenzo Sonoda, Tatsuhiro Ohgami, Masako Kijima, Keisuke Kodama, Masahiro Hachisuga, Shinichiro Yamaguchi, Hiroshi Yagi, Masafumi Yasunaga, Ichiro Onoyama, Hironori Kenjo, Eisuke Kaneki, Kaoru Okugawa, Yasuyuki Fujita, Hideaki Yahata, Kiyoko Kato.
Organizer
17th Biennial Meeting of the International Gynecologic Cancer Society.
Int'l Joint Research
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[Presentation] Oncological and obstetric management of women diagnosed with cervical cancer during pregnancy.2018
Author(s)
Kenzo Sonoda, Tatsuhiro Ohgami, Masako Kijima, Keisuke Kodama, Masahiro Hachisuga, Shinichiro Yamaguchi, Hiroshi Yagi, Masafumi Yasunaga, Ichiro Onoyama, Hironori Kenjo, Eisuke Kaneki, Kaoru Okugawa, Yasuyuki Fujita, Hideaki Yahata, Kiyoko Kato.
Organizer
第56回日本癌治療学会
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