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2017 Fiscal Year Research-status Report

超高速ゲノム解読に基づく骨格性下顎前突症感受性候補遺伝子の探索

Research Project

Project/Area Number 17K11949
Research InstitutionFukuoka Dental College

Principal Investigator

梶井 貴史  福岡歯科大学, 口腔歯学部, 准教授 (60322822)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡 晃  東海大学, 総合医学研究所, 講師 (80384866)
八田 光世  福岡歯科大学, 口腔歯学部, 准教授 (30344518)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywordsエクソーム解析 / 骨格性下顎前突症
Outline of Annual Research Achievements

ゲノムワイド関連解析では骨格性下顎前突症の強いリスクを伴う感受性候補遺伝子を突き止めることができなかった。そこで大家系を用いた全エクソーム解析により遺伝子機能に影響を与える原因変異を探索し、最終的には成長期の骨格性下顎前突症患者で将来外科手術が必要となるか否かを、成長期のうちに確定診断できるようにするることが本研究の目的である。
大家系(同一家系に14個体の骨格性下顎前突症罹患者)を用いた全エクソーム解析を行う前に、本年度はまず、4世代にわたる15個体から成る家系(うち罹患者5個体)を用いた全エクソーム解析を行った。罹患者4名、非罹患者5名のゲノムDNAからSureSelect v6+UTRsキットを用いてエクソームライブラリを調整し、次世代シークエンサーを用いてこのライブラリをシークエンスした。
その結果、罹患者4名の全てに認められ、非罹患者5名のいずれにも認められなかったエクソン領域の変異は、16個であった。この変異は、UBASH3B遺伝子、BEST3遺伝子、ARSD遺伝子上のエクソン領域上に存在していた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

大家系からのゲノムDNAサンプルはまだ得られていないものの、中規模の1家系からの全エクソーム解析を研究期間1年目にして既に行うことができたため。

Strategy for Future Research Activity

今年度に得られた全エクソーム解析の結果を、遺伝子連鎖解析を行うことにより追試する。また、大家系からのゲノムDNAサンプルの採取を引き続き行っていく。

Causes of Carryover

執行率98.9%と、ほぼ全額を使用した。
次年度には試薬等の消耗品を引き続き購入するので、その費用として用いる。

  • Research Products

    (4 results)

All 2018 2017

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Candidate gene analysis of mandibular prognathism2017

    • Author(s)
      Kajii TS, Oka A
    • Journal Title

      Journal of Dentistry and Oral Biology

      Volume: 2 Pages: Article1068

    • DOI

      https://pdfs.semanticscholar.org/9504/38a12862cce414e7cdb01b6b63a1d3eb44d6.pdf

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genome-wide association study for mandibular prognathism using microsatellite and pooled DNA method2017

    • Author(s)
      Saito F, Kajii TS, Oka A, Ikuno K, Iida J
    • Journal Title

      American Journal of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics

      Volume: 152 Pages: 382-388

    • DOI

      10.1016/j.ajodo.2017.01.021

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] The function of PLXNA2, which was suggested to be candidate genes by genome-wide association study for mandibular prognathism, on chondrocytes2018

    • Author(s)
      Kajii TS, Oka A, Iida J, Hatta M, Yamazaki J, Yamashita J, Tamaoki S
    • Organizer
      11th Asian Pacific Orthodontic Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genome-wide association study for mandibular prognathism using microsatellite2017

    • Author(s)
      Kajii TS
    • Organizer
      Translational Research Meeting with Dr. Thesleff at Fukuoka Dental College
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2018-12-17  

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