2017 Fiscal Year Research-status Report
ネットワーク解析に基づく歯・インプラント周囲細菌叢の情報基盤構築と新規治療法開発
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17K11981
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
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Principal Investigator |
竹内 康雄 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 講師 (60396968)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
丸山 史人 京都大学, 医学研究科, 准教授 (30423122)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 歯周炎 / インプラント周囲炎 / メタゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、次世代シーケンサーを用いて歯周炎とインプラント周囲炎に関連した細菌叢を網羅的に解析したデータに、宿主・環境因子や治療介入による臨床データを加え、統合的な細菌ネットワーク解析結果からデータベースを作成し、ここで得られた知見から、両疾患において発症予測や治療を行う上でターゲットとなる細菌や機能遺伝子を同定する。当初の予定ではインプラント周囲炎および歯周炎部位から歯肉縁下プラ－クを採取し、細菌RNAの解析を中心に進める予定であったが、サンプル抽出など条件がそろわなかったこともあり、本年は細菌DNAに基づく基に16S rRNA解析を主に進めてきた。インプラント周囲炎に関しては現在20症例程度のシークエンスを実施し、解析の途中である。健常部位と歯周炎部位については一部サンプルで解析が進んだ。両部位においてそれぞれの構成細菌種を比較したところ、歯周炎部位では既知の歯周病原細菌であるPorphyromonas gingivalis、Tannerella forsythiaといった細菌が高頻度に検出され、これまでの報告を裏付ける結果であった。一方でFilifactor alocisといったこれまであまり注目されていなかった細菌種も歯周炎部位において高頻度に認められた。本菌はネットワーク解析の結果、T. forsythiaやPrevotella intermideaといった歯周病原細菌と密な共起・排除関係が確認されたことから、歯周炎への関与が深いと推測し、今後も注目して解析を進めて行く予定である。臨床的パラメータとの関連については現在検討中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
若干の研究計画の変更はあったものの、歯周炎部位と健常部位における細菌叢解析は進んでおり、一部のデータはまとめて現在論文投稿中である。インプラント周囲炎についても一部サンプルはシークエンスが終了し、データベースに照合・解析を進めているところである。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続きサンプルの採取および解析を進める。患者都合等により治療後のサンプル採取が不可の症例がでてきているため、被験者の募集とサンプル採取は積極的に進めていく。
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| Causes of Carryover |
一部消耗品が予定よりも安価に買えたため使用額に差が生じた。これらは次年度予算と合わせて、細菌DNA・RNA抽出試薬、シークエンス用試薬など消耗品の購入にあてる。
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