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2017 Fiscal Year Research-status Report

生体ブラウニアンマシン集合系のデザインと協調メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 17K14375
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

岩城 光宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 上級研究員 (30432503)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Keywordsミオシン / DNAナノテクノロジー / 筋肉 / 1分子計測 / モータータンパク質 / ナノバイオ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、筋肉の収縮単位であるミオシンフィラメントをDNA ナノテクノロジーを駆使してデザインし、フィラメント内部のモーター分子群の動態や運動相関を1分子レベルで解析するのが目的である。本年度では、独自に作成した人工ミオシンフィラメントをアクチンフィラメント上に固定し、フィラメント内の筋肉ミオシン分子1個の動作を精密に測定することを行った。
ミオシン分子1個の動態を1nm, 数十マイクロ秒の時空間分解能で観察するために、金ナノ粒子をミオシン近傍にラベルし、マイクロミラータイプの全反射照明顕微鏡を構築した。この光学設計により、40マイクロ秒の時間分解能で0.5 nm (ガラス固定した金粒子位置の標準偏差)を得ることができた。ミオシン近傍にラベルした金ナノ粒子の動きを観察したところ、ATP存在下でノンプロセッシブな一方向運動が観察され、ATP濃度に依存してアクチンへの結合時間の変化が見られた。さらに、蛍光ATPとステップ運動との同時観察も行い、ミオシン由来の運動を観察している確認を取ることができた。従来の光ピンセット法を用いた1分子計測においては、ミオシンよりも20倍以上大きいプローブが必要であり、応答時間の遅さや回転弾性に起因するミオシン運動の検出限界が存在するが、本研究で開発した手法ではミオシン分子と同程度の40nm金粒子をbifunctionalに固定しているため、運動素過程を詳細に観察できると期待している。
今後は、観察条件のさらなる最適化を行い、フィラメント内の分子動態素過程を詳細に解析する予定である。また、フィラメントのすべり運動中に、複数のミオシン分子動態観察を行い、ミオシン分子間の運動相関を解析する準備も進めていく。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究では、従来の1分子計測手法ではハイスループットでの計測が難しい、モーター分子運動素過程を詳細に観察する新たな実験系開発が含まれている。DNAナノテクノロジーを組み合わせた新規性の高いストラテジーであり世界でも類を見ない。そのため、様々な困難が予想されたが、当該年度における目標であった、ミオシンフィラメント内部のミオシン1個の運動素過程観察をすでに実現することができたため、おおむね順調に進展していると考えている。実験条件のさらなる最適化を進めることで、従来の手法では観察できなかったイベントを捉えることができると期待している。
また、本研究の手法の利点である、ミオシンフィラメント内部の複数の分子運動動態観察を可能にするためのストラテジーも確立しているため、おおむね研究計画通りに伸展している。

Strategy for Future Research Activity

フィラメント内部のミオシン1個の運動素過程観察においては、前年度に引き続きデータの取得と解析作業を進める。本研究の時間分解能では、従来の手法では検出できなかった、ミオシンアクチン間の弱い相互作用とみられる結合も観察している可能性があるので、ミオシンのブラウン運動と弱い相互作用、力発生の素過程を客観的・定量的に解析するための統計的手法(隠れマルコフモデルなど)を用いて進めていく。
フィラメント内部のミオシン分子間の運動相関については、量子ドットの多色観察によって解析が可能になるため、ラベル方法の最適化などを進めていく。

Causes of Carryover

(理由)年度末近くになって購入予定だった試薬(人工ミオシンフィラメント作成用の合成オリゴ)の納入遅延が判明し納入に年度をまたぐ可能性がでて、発注をキャンセルしたため。
(使用計画)次年度始めに試薬を購入し人工ミオシンフィラメント作成を行い、実験を遂行する。

  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] パドバ大学(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      パドバ大学
  • [Presentation] A programmable DNA origami nanospring that reveals force-induced adjacent binding of myosin VI heads2017

    • Author(s)
      M. Iwaki
    • Organizer
      14th Annual Conference Foundations of Nanosciece (FNANO2017)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNAナノテクノロジーの生命科学研究への応用と現状2017

    • Author(s)
      岩城光宏
    • Organizer
      武田薬品工業株式会社セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 幹細胞分化の力学制御を指向したDNAナノデバイス開発2017

    • Author(s)
      岩城光宏
    • Organizer
      BioJapan2017
    • Invited
  • [Presentation] High-speed AFM imaging of DNA origami-myosin II motor hybrid system2017

    • Author(s)
      大町優史、福永裕樹、藤田恵介、池崎圭吾、柳田敏雄、岩城光宏
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Ultra-resolution imaging of RNA polymerases with DNA-PAINT for understanding the molecular mechanisms of cell individuality2017

    • Author(s)
      藤田恵介、柳田敏雄、岩城光宏
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
  • [Book] The role of water in ATP hydrolysis energy transduction by protein machinery2018

    • Author(s)
      M. Iwaki, K. Itoh, K. Fujita
    • Total Pages
      未定
    • Publisher
      Springer
  • [Book] バイオサイエンスとインダストリー(B&I)2018

    • Author(s)
      岩城光宏
    • Total Pages
      200 (160-161)
    • Publisher
      昭和情報プロセス株式会社
    • ISBN
      0914-8981
  • [Book] 自動車技術(超の世界)2017

    • Author(s)
      岩城光宏
    • Total Pages
      110 (96-97)
    • Publisher
      精興社
    • ISBN
      0385-7298
  • [Remarks] ナノバイオロボティクスグループ

    • URL

      http://www.qbic.riken.jp/cdo/iwaki-subg/index.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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