2019 Fiscal Year Annual Research Report
Detection of genetic modifiers in PRKN
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17K14966
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| Research Institution | Juntendo University |
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Principal Investigator |
大垣 光太郎 順天堂大学, 医学部, 准教授 (20459035)
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2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | パーキンソン病 / 遺伝子 / 疾患修飾遺伝子 / parkin / 神経科学 / 次世代シーケンサー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
当研究グループは劣性遺伝性若年性パーキンソン病(PD)の原因遺伝子として、parkin遺伝子の2アレル変異を単離し、さらにparkin遺伝子の1アレル変異においては比較的若年で発症する傾向を確認している。本研究は、parkin遺伝子の1アレル変異に着目し、その発症メカニズム解明を目指す。申請者は2つの仮説を立てた： 仮説①parkinのイントロン領域に、発症に深く関わるvariantが存在している。仮説②parkin以外の疾患修飾遺伝子が発症に関わっている。
＜仮説①の検証＞ (i) parkin１アレル変異患者と50名、(ii) parkin2アレル変異患者106名、(iii) 健常コントロール132名、合計288名でイントロン領域の解析を行った。遺伝子解析は終了し、情報解析中であるが、parkinは巨大遺伝子でありそのイントロンにはリピート配列が多く含まれ、より正確なデータ解析のためには、今回用いたショートリードではなく、今後ロングリードNGSでの解析が必要であり検討中である。
＜仮説②の検証＞既知のPD関連遺伝子や、parkinと関連が推測される遺伝子、リソソーム病原因遺伝子、合計79遺伝子をリストアップし、上記の(i) (ii) (iii) の３群で、遺伝子解析を行った。(i) parkin 1 アレル変異患者群 vs (iii)コントロール群の比較によりGene Xのvariant A が、発症riskとなる可能性を見出した (19% vs 10%, P=0.035, OR 2.02, 95%CI 1.00-4.00)。Gene Xはparkinの発現量を調整することで、PDの細胞モデルで細胞死に対し保護的に働くことが知られている。現在、細胞実験系を用いて Gene Xのvariant Aがparkinの発現に与える影響について解析を進めている。
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[Presentation] Detection of genetic modifiers in parkin2019
Author(s)
Kotaro Ogaki, Hirofumi Nakaoka, Kensuke Daida, Arisa Hayashida, Aya Ikeda, Yuanzhe Li, Hiroyo Yoshino, Manabu Funayama, Kenya Nishioka, Ituro Inoue, Nobutaka Hattori
Organizer
第60回日本神経学会学術大会
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