解剖学的手法を用いたダイコンの多様な根形を生み出す遺伝的なメカニズムの解明

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 17K15221
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 吉田 康子 神戸大学, 農学研究科, 助教 (50582657)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: ダイコン / 肥大成長 / 組織学的観察 / 木部柔組織 / RNA-seq / RAD-seq

Outline of Annual Research Achievements

ダイコンの多様な根形は、肥大成長の「程度」と「有無」、またそれらの「場所」が異なることによって生み出されていると考えられる。これまでに、組織学的観察によって肥大成長の「有無」には形成層が不可欠であることや、肥大の「程度」には二次形成層が存在すること、そして品種によって木部柔細胞の数が多い品種と一個あたりの木部柔細胞が大きい品種があることが明らかになった。そこで、昨年度に肥大成長の「程度」に関わる発現遺伝子を経時的に把握するために、４品種を栽培し、肥大成長が始まっていない時期（播種後２週間）から収穫適期まで１週間ごとに写真撮影と形態学的調査、サンプリング採取を行った。そこに肥大しないダイコン「小瀬菜」を解析に加えることで、肥大の「有無」に関わる発現遺伝子の特定も可能であると考え、「小瀬菜」のRNA-seq解析用のサンプル採取と組織観察用のサンプル採取の２種類を行う予定でいたが、本年度は栽培および実験を行うことができなかったため次年度に行うことにし、RAD-seq解析を進めている。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

4月から新型コロナウィルスのため実験が行えず、解析に必要なサンプルの準備が行えなかった。また7月から産休・育休に入ったため、予定していた実験を進めることができなかったため。

Strategy for Future Research Activity

8月に復職するため、ダイコンの栽培適期である9月にRNA抽出を終えていないの１品種を栽培し、適時RNAを抽出する。すべてのサンプルが準備でき次第、RNA-seq解析の外注を行う。

Causes of Carryover

今年度に外部委託を行う予定であったRNA-seq解析に必要なサンプルの準備ができず、解析費分が使用できなかったため。