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2017 Fiscal Year Research-status Report

新規ヒストンO-Glc NAc修飾による栄養状態依存的Nodal遺伝子制御機構

Research Project

Project/Area Number 17K15391
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

新井 大祐  早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員(研究院講師) (20624951)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywordsエピジェネティクス
Outline of Annual Research Achievements

H2AS40-Gcはグルコース反応性のヒストン修飾であり、遺伝子発現やゲノム修復などへの関与が示されつつある。研究代表者は先行研究において、マウスES細胞においてNodal遺伝子のエピジェネティック制御領域(ERE)がH2AS40-Gcを受けており、培地中のグルコース濃度により修飾レベルが変化することを見出している。本年度はグルコース・H2AS40-GcがEREを介してNodal遺伝子発現におよぼす影響に関して研究を進めた。(1)培地中のグルコース濃度がNodal遺伝子発現に与える影響を調べるため、マウスES細胞を25 mM(high glucose)と5.5 mM(low glucose)で培養し、RT-qPCR解析を行ったが、有意な変化は認められなかった。(2)ゲノム標的特異的H2AS40-Gc調節による機能解析のための準備を進めた。pPlatTET-gRNA2(Morita et al., Nat Biotechnol. 2016)をベースとして、O-GlcNAc転移酵素OGTにscFvタグを融合し、dCas9-SunTagと共発現することで、ゲノム上の任意の領域にOGTをリクルートできるベクターを構築した。(3)CRISPR/Cas9 法によりEREを様々な長さで欠失させたマウスES細胞を樹立した。これについてNodal遺伝子の発現状況を比較した結果、特定のOct4結合モチーフがNodal発現誘導に必須であることが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

初年度に予定していたES細胞以外の解析が完了しておらず、早急に進めていく必要がある。一方、ERE領域欠失細胞の作出と転写因子モチーフの同定は予定よりも早く達成された。欠失細胞はメカニズム解析のツールとしても有用であり、二年目以降の研究を加速させうる。ゲノム標的特異的H2AS40-Gc調節の試みは順調に進んでおり、実証実験に移行する。

Strategy for Future Research Activity

Nodal遺伝子のH2AS40-Gc修飾標的領域をマウス分化細胞やヒト正常細胞・がん細胞で解析し、プロファイリングを完了する。ERE領域欠失細胞について、H2AS40-GcやH3K27me3状態の変化、両者の相互関係、細胞分化の影響を解析する。ゲノム標的特異的H2AS40-Gc調節の実証実験として、初年度に構築したベクターを培養細胞に一過的に発現させ、Ogtの標的への局在とH2AS40-Gcの変化を確認する。

Causes of Carryover

おおよそ計画通りに支出したが、若干の誤差が生じた。少額であり、次年度の消耗品に充てる。

  • Research Products

    (2 results)

All 2017

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results)

  • [Journal Article] Halistanol sulfates I and J, new SIRT1?3 inhibitory steroid sulfates from a marine sponge of the genus Halichondria2017

    • Author(s)
      Nakamura Fumiaki、Kudo Norio、Tomachi Yuki、Nakata Akiko、Takemoto Misao、Ito Akihiro、Tabei Hodaka、Arai Daisuke、de Voogd Nicole、Yoshida Minoru、Nakao Yoichi、Fusetani Nobuhiro
    • Journal Title

      The Journal of Antibiotics

      Volume: 71 Pages: 273~278

    • DOI

      10.1038/ja.2017.145

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A quantitative shRNA screen identifies ATP1A1 as a gene that regulates cytotoxicity by aurilide B2017

    • Author(s)
      Takase Shohei、Kurokawa Rumi、Arai Daisuke、Kanemoto Kanto Kind、Okino Tatsufumi、Nakao Yoichi、Kushiro Tetsuo、Yoshida Minoru、Matsumoto Ken
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 1~9

    • DOI

      10.1038/s41598-017-02016-4

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-12-17  

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