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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Development of a new foldamer as a mimetic of alfa-helix

Research Project

Project/Area Number 17K15476
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

渡邉 瑞貴  北海道大学, 薬学研究院, 講師 (20507173)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Keywordsフォルダマー / 配座制御 / ペプチドミメティクス
Outline of Annual Research Achievements

【目的】タンパク質間相互作用は、生体の恒常性維持において重要かつ様々な役割を担う。特定のタンパク質間相互作用を制御できる分子は、生物医学研究のツールや新たな医薬品シーズとなりうる。実際に、タンパク質間相互作用を阻害するバイオ医薬品(例:抗体)が臨床応用されている。しかし、高コスト、免疫毒性、また、標的が細胞膜表面に限定的といった課題も残っており、より低コストで細胞内外のタンパク質間相互作用を制御可能な合成分子が求められている。このような状況下、らせんなどの特定の二次構造をとる人工オリゴマー分子(フォルダマー)は、タンパク質の二次構造を模倣できるため、タンパク質間相互作用を制御可能な分子として注目されている。現在までに多様な骨格のフォルダマーが開発されているが、その配座自由度の高さ故かδ-アミノ酸を基盤にしたフォルダマーの報告例はない。そこで本研究では、配座制御能が高いシクロプロパンで配座制御することでδ-アミノ酸を基盤にしたフォルダマーを創製し、新たなペプチドミメティクスとして応用することを目指した。
【方法と結果】様々な立体化学の光学活性シクロプロパンδ-アミノ酸オリゴマーを設計し、マクロモデルを用いてそれらの最安定配座を計算したところ、特定の立体異性体のホモオリゴマーが、安定な右巻きヘリックスを形成することが期待された。実際にその光学活性シクロプロパンδ-アミノ酸モノマーを、光学活性グリシドールから不斉補助基を利用した立体選択的Grignard反応および不斉アルキル化を経て、18工程で合成した。種々の長さにオリゴ化後、その立体構造のCD測定やNMR測定、およびX線結晶構造解析を行った。その結果、6量体以上のオリゴマーで、計算通りのらせん二次構造を形成していることが分かった。

  • Research Products

    (19 results)

All 2019 2018

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Synthesis of Enantiomerically Pure 1,2,3-Trisubstituted Cyclopropane Nucleosides Using Pd-Catalyzed Substitution via Directing Group-Mediated C(sp3)-H Activation as a Key Step2019

    • Author(s)
      Minami Takaaki、Fukuda Kohtaro、Hoshiya Naoyuki、Fukuda Hayato、Watanabe Mizuki、Shuto Satoshi
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 21 Pages: 656~659

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.8b03785

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Live-cell imaging of multiple endogenous mRNAs permits the direct observation of RNA granule dynamics2018

    • Author(s)
      Yatsuzuka Kenji、Sato Shin-ichi、Pe Kathleen Beverly、Katsuda Yousuke、Takashima Ippei、Watanabe Mizuki、Uesugi Motonari
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 54 Pages: 7151~7154

    • DOI

      10.1039/C8CC03805H

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of Chiral cis-Cyclopropane Bearing Indole and Chromone as Potential TNFα Inhibitors2018

    • Author(s)
      Kanada Ryutaro、Tanabe Makoto、Muromoto Ryuta、Sato Yukina、Kuwahara Tomoki、Fukuda Hayato、Arisawa Mitsuhiro、Matsuda Tadashi、Watanabe Mizuki、Shuto Satoshi
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 83 Pages: 7672~7682

    • DOI

      10.1021/acs.joc.8b00466

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Resolvin E1, but not resolvins E2 and E3, promotes fMLF-induced ROS generation in human neutrophils2018

    • Author(s)
      Unno Yuka、Sato Yoshinori、Fukuda Hayato、Ishimura Kohei、Ikeda Hiroyuki、Watanabe Mizuki、Tansho-Nagakawa Shigeru、Ubagai Tsuneyuki、Shuto Satoshi、Ono Yasuo
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 592 Pages: 2706~2715

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13215

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of cyclopropane-based conformationally restricted GABA analogues as selective inhibitors for betaine/GABA transporter 12018

    • Author(s)
      Suemasa Akihiro、Watanabe Mizuki、Kobayashi Takaaki、Suzuki Hiroe、Fukuda Hayato、Minami Masabumi、Shuto Satoshi
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 28 Pages: 3395~3399

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2018.08.031

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of histamine H3/H4 receptor ligands with a cyclopropane scaffold2018

    • Author(s)
      Watanabe Mizuki、Kobayashi Takaaki、Ito Yoshihiko、Fukuda Hayato、Yamada Shizuo、Arisawa Mitsuhiro、Shuto Satoshi
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 28 Pages: 3630~3633

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2018.10.041

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] スピロシクロプロパン型αヘリックス・βストランドミメティクスに基づくp53/MDM2結合阻害剤の創製2019

    • Author(s)
      桑原智希、水野彰、 竹内恒、広川貴次、浅井章良、渡邉瑞貴、周東智
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
  • [Presentation] 環状ペプチド低分子化方法論の確立を目指した三次元多様型シクロプパンペチドミメティスの開発研究 三次元多様型シクロプパンペチドミメティスの開発研究2019

    • Author(s)
      杉山洸, 一ノ瀬亘, 広川貴次, 渡邉瑞貴, 周東智
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
  • [Presentation] 炎症収束脂質レゾルビン E2のスキップジエン構造をベンゼン環で置換した安定等価体創製研究2019

    • Author(s)
      村上 侑斗, 福田 隼, 石村 航平, 平島 洸基, 室本 竜太, 渡邉 瑞貴, 松田 正, 周東 智
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
  • [Presentation] ペプチドの"形"を制御して"機能"を変える2018

    • Author(s)
      渡邉瑞貴
    • Organizer
      第50回若手ペプチド夏の勉強会
    • Invited
  • [Presentation] シクロプロパン δ-アミノ酸を基盤とした新規フォルダマーの創製研究2018

    • Author(s)
      永田真、桑原智希、 一ノ瀬亘、 渡邉瑞貴、周東智
    • Organizer
      日本薬学会北海道支部第 145回例会
  • [Presentation] アデノホスチンAをリードとしたIP3検出プローブの創出2018

    • Author(s)
      渡邉瑞貴、森川優輝、大浦泰、福田隼、森田貴雄、谷村明彦、周東智
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第13回年会
  • [Presentation] サイトトリエニンAの合成研究2018

    • Author(s)
      佐藤晋平,福田隼,渡邉瑞貴,周東智
    • Organizer
      第30回万有札幌シンポジウム
  • [Presentation] Synthetic Study of Cytotrienin A2018

    • Author(s)
      Shimpei Sato, Hayato Fukuda, Mizuki Watanabe, Satoshi Shuto
    • Organizer
      7th EuCheMS Chemistry Congress
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] サイトトリエニンAの合成研究2018

    • Author(s)
      佐藤晋平,福田隼,渡邉瑞貴,周東智
    • Organizer
      第44回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] Pd触媒を用いたC(sp3)-H活性化反応を鍵段階とする光学活性1,2,3-三置換シクロプロパンヌクレオシドの合成2018

    • Author(s)
      南貴覚,福多洸太朗,星谷尚亨,福田隼,渡邉瑞貴,周東智
    • Organizer
      第44回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] Conformationally Restricted Cyclic Peptides Based on the Structural Properties of Cyclopropane2018

    • Author(s)
      Mizuki Watanabe, Mai Uemura, Yukina Sato, Nanami Kato, Yoh Takekuma, Mitsuru Sugawara, Koh Takeuchi, Satoshi Shuto
    • Organizer
      8th Peptide Enginierring Meeting (PEM8-2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Improvement of Membrane Permeability of Cyclic Peptides By Conformational Restriction Using Cyclopropane2018

    • Author(s)
      Mizuki Watanabe, Yukina Sato, Mai Uemura, Nanami Kato, Kouhei Matsui, Hayato Fukuda, Yoh Takekuma, Mitsuru Sugawara, Satoshi Shuto
    • Organizer
      10th International Peptide Symposium(第55回ペプチド討論会)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Improvement of Membrane Permeability of Cyclic Peptides By Conformational Restriction Using Cyclopropane2018

    • Author(s)
      Mizuki Watanabe, Yukina Sato, Mai Uemura, Nanami Kato, Kouhei Matsui, Hayato Fukuda, Yoh Takekuma, Mitsuru Sugawara, Satoshi Shuto
    • Organizer
      The 24th Peptide Forum in Kyoto, 2018
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-12-27  

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