Identification of novel, interferon-inducible anti-AIDS virus host factors

2018 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17K15701
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Virology
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: Saito Akatsuki 大阪大学, 微生物病研究所, 特任助教(常勤) (30621792)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: 宿主因子 / エイズウイルス / インターフェロン

Outline of Final Research Achievements

In this research project, we sought to identify a novel, type I IFN-inducible anti-HIV host factors in T cells. We performed RNA-Seq analysis using samples of two T cell lines that showed distinct antiviral effect upon IFN treatment. We identified doses of candidate genes upregulated in a cell line that strongly inhibit HIV infection upon IFN treatment. We used the CRISPR-Cas9 system to knockout candidate genes. Our results showed that gene depletion of known antiviral host factors diminished antiviral effect upon IFN treatment. Further screening of candidate genes is now in progress.

Free Research Field

ウイルス学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまで、我々を含む国内外の研究グループにより、未同定のIFN誘導性のエイズウイルス感染阻害因子が存在することが示唆されている。近年のオミックス研究の飛躍的な進歩により、遺伝子発現レベルの網羅的解析が比較的容易になってきてはいるが、適切なコントロールがない場合、莫大な量のデータから目的遺伝子を特定するのは容易ではない。我々が今回行ったRNA-Seq実験では、IFN処理によりHIV感染を阻害する細胞でのみ発現レベルが上昇する遺伝子を効率よく抽出できた。現在限られた数の候補遺伝子の評価を進めており、長年解明が求められていたエイズウイルス抑制因子の解明に貢献していきたい。