2018 Fiscal Year Research-status Report

急性リンパ性白血病における変則V(D)J組み換えの微小残存病変としての有用性

Research Project

Project/Area Number	17K16174
Research Institution	Hokkaido University
Principal Investigator	岡田耕平北海道大学, 医学研究院, 客員研究員 (30792501)
Project Period (FY)	2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords	IKZF1欠失
Outline of Annual Research Achievements	急性リンパ性白血病細胞株及び臨床検体を用いて、IKZF1, BTG1, CDKN2A, SLX4IP, TAL1, CD200/BTLA、ERGの変則V(D)J組み換えによる欠失変異を確認した。検出できたV（D）J欠失については、ダイレクトシークエンスにて、欠失部位の配列を確認し、V(D)J組み換えによる腫瘍特異的欠失が起きていることを確認した。最も欠失頻度が多いのはIKZF1であり、IKZF1欠失に注目して以後の検討を行った。急性リンパ性白血病においてIKZF1欠失は予後不良因子となることが報告されているが、大規模コホートの次世代シークエンスあるいはMLPA法による検討が中心で、これまで日常臨床で検出可能な標準検査法が確立されていない。今回我々はIKZF1欠失の中で最も頻度の多いIKZF1Δ4-7について、デジタルPCRで定量的に変異アリル頻度を検出する方法を開発した。IKZF1欠失細胞株のゲノムDNAの段階希釈を用いて、RQ-PCR法との相関を検討した。デジタルPCRでは段階希釈による検量線を書く必要がなく、絶対定量が可能である。IKZF1欠失はゲノムDNAで検出することができ、検体採取から半日ほどで結果を得ることができる。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason IKZF1欠失をFISH法、およびデジタルPCRでのIKZF1Δ4-7検出法を確立し、論文報告を行なった。
Strategy for Future Research Activity	開発したFISH、デジタルPCRによるIKZF1欠失検出法を用い、臨床検体での有用性を確認する。