2018 Fiscal Year Research-status Report
急性リンパ性白血病における変則V(D)J組み換えの微小残存病変としての有用性
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17K16174
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Research Institution | Hokkaido University |
Principal Investigator |
岡田 耕平 北海道大学, 医学研究院, 客員研究員 (30792501)
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Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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Keywords | IKZF1欠失 |
Outline of Annual Research Achievements |
急性リンパ性白血病細胞株及び臨床検体を用いて、IKZF1, BTG1, CDKN2A, SLX4IP, TAL1, CD200/BTLA、ERGの変則V(D)J組み換えによる欠失変異を確認した。検出できたV(D)J欠失については、ダイレクトシークエンスにて、欠失部位の配列を確認し、V(D)J組み換えによる腫瘍特異的欠失が起きていることを確認した。 最も欠失頻度が多いのはIKZF1であり、IKZF1欠失に注目して以後の検討を行った。急性リンパ性白血病においてIKZF1欠失は予後不良因子となることが報告されているが、大規模コホートの次世代シークエンスあるいはMLPA法による検討が中心で、これまで日常臨床で検出可能な標準検査法が確立されていない。今回我々はIKZF1欠失の中で最も頻度の多いIKZF1Δ4-7について、デジタルPCRで定量的に変異アリル頻度を検出する方法を開発した。IKZF1欠失細胞株のゲノムDNAの段階希釈を用いて、RQ-PCR法との相関を検討した。デジタルPCRでは段階希釈による検量線を書く必要がなく、絶対定量が可能である。IKZF1欠失はゲノムDNAで検出することができ、検体採取から半日ほどで結果を得ることができる。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
IKZF1欠失をFISH法、およびデジタルPCRでのIKZF1Δ4-7検出法を確立し、論文報告を行なった。
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Strategy for Future Research Activity |
開発したFISH、デジタルPCRによるIKZF1欠失検出法を用い、臨床検体での有用性を確認する。
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[Journal Article] Development of a Fluorescence in Situ Hybridization Probe for Detecting IKZF1 Deletion Mutations in Patients with Acute Lymphoblastic Leukemia.2018
Author(s)
Hashiguchi J, Onozawa M, Oguri S, Fujisawa S, Tsuji M, Okada K, Nakagawa M, Hashimoto D, Kahata K, Kondo T, Shimizu C, Teshima T.
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Journal Title
J Mol Diagn.
Volume: 20
Pages: 446-454
DOI
Peer Reviewed