2019 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of molecular mechanism of carcinogenesis based on stratification of hereditary colorectal cancer
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17K16530
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
高根 希世子 東京大学, 医科学研究所, 助教 (60756112)
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2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 家族性大腸腺腫症 / 大腸癌 / 大腸腺腫 / DNAメチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
家族性大腸腺腫症（FAP）は、大腸癌を発症する素因を持つ、多数の結腸直腸腺腫を特徴とする遺伝性疾患である。今回我々はInfinium 450k ビーズアレイを使用して、7個の癌サンプルと16個の腺腫サンプルを含むFAP腫瘍のゲノムワイドなDNAメチル化解析を行った。比較対象として、散発性大腸腫瘍および正常粘膜について、The Cancer Genome Atlasおよびその他のデータベースを参照し、297個の散発性大腸癌、45個の散発性大腸腺腫、および37個の正常粘膜のInfinium 450kデータを使用した。FAPと散発性大腸癌/腺腫、正常粘膜の階層クラスタリング分析により、散発性大腸癌が4つのDNAメチル化エピジェノタイプ（ME）、高ME（HME）、中間ME（IME）、低ME（LME）、および通常のME（NME）に分類されたことが明らかになった。 5個のFAP腫瘍（2個の癌と3個の腺腫）はIMEとクラスター化されたが、18個のFAP腫瘍（5個の癌と13個の腺腫）はNMEにクラスター化された。 IME FAP腫瘍は散発性大腸癌と同様に、KRAS変異と有意に相関していた。ただし、IME内におけるDNAメチル化頻度は、FAP腫瘍は散発性腫瘍よりも有意に低く、これらの非メチル化遺伝子には、WNTファミリー遺伝子およびいくつかの発癌関連遺伝子が含まれていた。以上のことから、FAP腫瘍は少なくとも、異常なメチル化を示さないNMEタイプと、KRAS変異を伴うIMEタイプの2つの分子サブタイプに分類され、散発性腫瘍よりもDNAメチル化頻度が低いことから、散発性腫瘍とは異なる腫瘍形成経路をたどるといえる。
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Research Products
(3 results)
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[Journal Article] Development of an MSI-positive colon tumor with aberrant DNA methylation in a PPAP patient.2019
Author(s)
Yamaguchi K, Shimizu E, Yamaguchi R, Imoto S, Komura M, Hatakeyama S, Noguchi R, Takane K, Ikenoue T, Gohda Y, Yano H, Miyano S, Furukawa Y.
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Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: 64
Pages: 729-740
DOI
Peer Reviewed
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