頭頸部扁平上皮癌の腫瘍内不均一性の解明

2018 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 17K16923
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: 内 龍太郎 九州大学, 大学病院, 医員 (80780840)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 舌癌

Outline of Annual Research Achievements

腫瘍内不均一性は癌の難治性に寄与していると考えられている。本研究では解明の進んでいない頭頚部扁平上皮癌について、ゲノム・エピゲノム・トランスクリプトームレベルそれぞれの腫瘍内不均一性を明らかにすること及び、その解析結果から頭頚部扁平上皮癌のクローン進化の一端を明らかにすることを目的としている。
昨年度までは核酸抽出の予備実験及び、症例集積を行った。本年度も引き続き症例集積を行い、予定した症例の集積が完了した。症例は①頭頚部扁平上皮癌であり、②複数個所からの検体採取で診断に影響を与えず、③前治療による修飾が加わらないという条件のもと選定した。他の頭頸部癌ではマルチサンプリングが困難であったため、進行舌癌症例からのマルチサンプリングによる検体採取を行った。
腫瘍の大きさによって採取個所数は異なるが、病理診断に影響のない、すなわちサンプリングにより深達度が変わらない隆起性の腫瘍からそれぞれ、2~4か所のサンプリングを施行した。また、摘出標本内のうち腫瘍から離れた正常舌部分からのサンプリングを行い、保護液にて保存後に拡散抽出の準備を行った。予定した標本数がそったため、抽出したDNAをゲノムシークエンスおよびメチル化アレイに提出し、正常部と比較することでその異常を明らかにする。またRNAについてはトランスクリプトーム解析を行うことで、その異常を明らかにする。また一症例内の異常について各部位間の比較を行うことによって不均一性について明らかにしていきたい。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

病理診断に影響のない範囲で行うため、症例集積の困難さがあり、症例集積がおくれたため。

Strategy for Future Research Activity

予定通り、随時シークエンスによるゲノム解析を行い、解析結果から不均一性解明を行う。

Causes of Carryover

30年度に予定していたゲノム解析外注への提出に遅れが生じ、次年度での使用となったため