2018 Fiscal Year Annual Research Report
Creation of new diagnostic methods and epigenome therapy for oral cancer based on extracellular environment responsive epigenome analysis
Project/Area Number |
17K17274
|
Research Institution | Kumamoto University |
Principal Investigator |
中元 雅史 熊本大学, 医学部附属病院, 診療助手 (90779175)
|
Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2019-03-31
|
Keywords | エピジェネティクス / 口腔癌 |
Outline of Annual Research Achievements |
ANGPTL4遺伝子は低酸素誘導因子であるHIF1αの下流の遺伝子であることが報告されているが、OSCCにおいてもその制御下にあるのかは不明であった。そこで、低酸素環境下培養OSCC細胞株におけるANGPTL4の発現を調べ、通常酸素環境下培養のOSCC細胞株での発現と比較し、OSCC細胞株でもANGPTL4がHIF1αの下流の遺伝子であることを確認した。OSCCでのANGPTL4遺伝子座におけるHIF1αとCTCFの結合領域はわかっていなかった。そこで、それぞれの結合モチーフをもとに、両者の結合部位を同定し、通常酸素環境下と低酸素環境下それぞれで培養したOSCC細胞株でのHIF1αとCTCFの結合の変化および関係性について調べた。また、HIF1αの結合領域でのH3K4me1(ヒストンH3の4番目のリジン残基のモノメチル化)やH3K27Ac(ヒストンH3の27番目のリジン残基のアセチル化)などのEnhancerマークであるヒストン修飾の変化を調べた。低酸素環境下でのクロマチン構造の変化を捉えるために、3Cアッセイを検討中である。
|