Characterization of Bradyrhizobium bacteria isolated from sugar beet

2018 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17K17966
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: 鶴丸 博人 鹿児島大学, 農水産獣医学域農学系, 助教 (60545226)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: Bradyrhizobium / テンサイ / 植物生育促進

Outline of Annual Research Achievements

今年度の研究の目的は、「テンサイ由来の細菌ライブラリーの中に、作物生育促進能を持つBradyrhizobium属細菌がいるのか」を確かめることである。
16S rRNA遺伝子のほぼ全長配列を用いて、blast検索と系統解析を行い、テンサイ由来の細菌ライブラリーから、29株をBradyrhizobium属細菌として簡易同定した。しかし、これらの株の中には、Bradyrhizobiaceae科の別な属として（Bradyrhizobium属以外の属細菌として）、同定することが適切な株が、複数含まれていた。これは、Bradyrhizobium属細菌の標準菌株（type strain）でさえも、データベースに登録されている16S rRNA遺伝子のほぼ全長配列が、1262 bpと短い場合があることが、原因であった。これらを考慮し、最終的には、テンサイ由来の細菌ライブラリーから、15株をBradyrhizobium属細菌として同定した。このうちゲノム解析済みの4株を、テンサイに接種した。これら4菌株は、Bradyrhizobium属の異なる「種」としてそれぞれ同定されたものである。テンサイ由来の細菌ライブラリーで、Bradyrhizobiaceae科の新種候補となる株も、テンサイへの接種菌株として使用した。無接種区ならびにテンサイ由来の既知のBradyrhizobium属細菌（標準菌株）を、対照区として用いた。約1ヵ月の栽培後に植物重量を測定し、テンサイ生育促進能を評価した。