2017 Fiscal Year Research-status Report
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17K18928
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| Research Institution | Akita Prefectural University |
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Principal Investigator |
長谷川 兼一 秋田県立大学, システム科学技術学部, 教授 (50293494)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
福島 淳 秋田県立大学, 生物資源科学部, 教授 (00181256)
藤 晋一 秋田県立大学, 生物資源科学部, 教授 (40315601)
金澤 伸浩 秋田県立大学, システム科学技術学部, 准教授 (40315619)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2020-03-31
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| Keywords | 家庭内真菌 / DNA解析 / 同定 / 定量化 / 評価手法 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は，DNA解析技術を用いた測定手法の開発(研究項目(1))と開発した測定手法の実用性の検証(研究項目(2))に取り組む。本年度は，以下に示す研究項目(1)を進めた。
研究項目(1)：DNA解析技術を用いた測定手法の開発
主として東北地方に建設されている住宅を対象として実測調査し，家庭内の床ダストを収集し，これらをDNA解析の対象とした。床ダストの捕集では，汎用のフィルタを掃除機の吸引口に装着し，居間と寝室のそれぞれに対して，床の全面のダストを捕集した。DNA解析では，床ダストの約50mgからDNAを定法により抽出し，真菌リボソーマルRNA遺伝子のITS2領域をターゲットとするプライマーを使用してPCR増幅を行った。本研究では，次世代シークエンサーを用いて真菌の同定が可能な技術開発に取りかかっているが，最終的には，真菌種のOTU(Operational Taxonomy Unit)を求め，OTUに含まれる配列数により，その生物種の比存在量を推定した。一方で，申請者らは，ダンプネスの程度を評価する手法を開発しており，程度の重篤度に合わせて4つの階級により評価できる。ダンプネスの程度を評価するために，別途，アンケート調査も実施し情報を取得した。この評価結果と，床ダストに含まれる真菌叢とを照らし合わせると，ダンプネスの程度が重篤である群では，真菌汚染に寄与する種の生存比率が高いことが分かった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
住宅の床ダストの捕集からDNA解析による評価値の算出までの一連のプロトコールが構築されつつある。床ダストの捕集の際に生じるばらつきや，OTUに基づく真菌叢の評価には課題が残されているものの，今後の検証過程において修正し，評価法として妥当であることを示す。
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| Strategy for Future Research Activity |
評価値の再現性や，現場でのダスト捕集によるデータのばらつきを低減するべく，実測調査を継続する。
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| Causes of Carryover |
床ダストのサンプリング作業が遅れたため，関連する消耗品購入を次年度に使用することとした。また，実測調査の日程を調整することができず，研究グループ全員が参加せずに実行したため，旅費の支出が抑えられた。次年度はその分を旅費に振り分ける。
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