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2017 Fiscal Year Research-status Report

オルガネラ創造の基盤構築を目指したゼニゴケ油体形成機構の研究

Research Project

Project/Area Number 17K19412
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

上田 貴志  基礎生物学研究所, 細胞動態研究部門, 教授 (10311333)

Project Period (FY) 2017-06-30 – 2019-03-31
Keywordsゼニゴケ / 油体 / SNARE / 分泌経路 / 進化
Outline of Annual Research Achievements

油体は苔類のみに存在するオルガネラで,内部にMarchantinなどの様々な生理活性物質を蓄積する.この油体が獲得された仕組みを明らかにし,それを将来のオルガネラ創造の基盤とするため,平成29年度にはまずゼニゴケの油体を単離するための方法論の確立を目指した.油体を単離するためには,まず油体を含む細胞である油体細胞を単離することが必要となる.そこで,ゼニゴケの葉状体を構成する細胞を機械的処理や酵素処理により分離させる方法を模索した.これまでの実験により,シロイヌナズナなどで用いられる酵素処理の条件ではゼニゴケ葉状体のプロトプラスト化は出来ないことが分かっている.そこで酵素濃度や機械的処理の条件を検討した結果,ブレンダーで葉状体を破壊し,濾過した後に酵素処理することで,油体細胞を含む葉状体細胞を解離させることが出来るようになった.この細胞の解離の効率を向上させるため,現在も引き続き条件の検討を進めている.
また,本研究課題と並行して進めていた油体形成が異常となる変異体の順遺伝学的探索の過程で,過剰発現により油体細胞分化を高進させることが出来る転写因子の単離に成功した.この転写因子の機能欠失変異体では,油体細胞の分化が全く起こらない.そこで,油体過剰蓄積変異体および油体欠失変異体を用いてRNAseq解析をおこない,油体形成に関わる因子の網羅的探索をおこなった.その結果,膜局在型の輸送体を含む多くの膜タンパク質を同定することが出来た.これらの中には,油体に局在するタンパク質が多く含まれると期待される.そこで現在,それら候補タンパク質をコードする遺伝子のクローニングを進めるとともに,ゲノム編集技術を用いた機能欠失変異体の作成準備を進めている.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

油体の単離に向けた条件検討が進んでいる.また,並行して進めていた順遺伝学的な研究の成果から,油体を構成するタンパク質の候補が多く得られたため.その知見も取り入れつつ研究を進めることが可能となった.

Strategy for Future Research Activity

今後も油体の単離方法の確立を目指すとともに,油体を過剰に蓄積する変異体からの油体の単離にも挑戦する.また,RNAseq解析により得られた油体タンパク質候補についても,引き続き解析を進める.

Causes of Carryover

本年度はゼニゴケ葉状体からの細胞単離の実験を重点的に進めたため,試薬等の購入の必要が無かった.現在は細胞単離方法の確立の目途が立ち,さらに油体の構成タンパク質の候補が多く得られていることから,平成30年度には分子生物学的実験,細胞生物学的実験を一気に進めることが必要となり,さらに研究成果や共同研究者との意見交換のための旅費も必要となるため,当該年度分と合わせて必要額を執行する予定である.

  • Research Products

    (18 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] Heidelberg University/Max Planck Institute(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Heidelberg University/Max Planck Institute
  • [Int'l Joint Research] ETH Zurich(Switzerland)

    • Country Name
      Switzerland
    • Counterpart Institution
      ETH Zurich
  • [Int'l Joint Research] Monash University(Australia)

    • Country Name
      Australia
    • Counterpart Institution
      Monash University
  • [Int'l Joint Research] University of Toronto(Canada)

    • Country Name
      Canada
    • Counterpart Institution
      University of Toronto
  • [Journal Article] Distinct sets of tethering complexes, SNARE complexes, and Rab GTPases mediate membrane fusion at the vacuole in Arabidopsis2018

    • Author(s)
      Takemoto Kodai、Ebine Kazuo、Askani Jana Christin、Kruger Falco、Gonzalez Zaida Andres、Ito Emi、Goh Tatsuaki、Schumacher Karin、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA.

      Volume: 115 Pages: E2457~E2466

    • DOI

      https://doi.org/10.1073/pnas.1717839115

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] RAB GTPases in the Basal Land Plant Marchantia polymorpha2018

    • Author(s)
      Minamino Naoki、Kanazawa Takehiko、Era Atsuko、Ebine Kazuo、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      Plant Cell Phys.

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      https://doi.org/10.1093/pcp/pcy027

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Cellulose Synthases Are Cargo of the TPLATE Adaptor Complex2018

    • Author(s)
      Sanchez-Rodriguez Clara、Shi Yanyun、Kesten Christopher、Zhang Dongmei、Sancho-Andres Gloria、Ivakov Alexander、Lampugnani Edwin R.、Sklodowski Kamil、Fujimoto Masaru、Nakano Akihiko、Bacic Antony、Wallace Ian S.、Ueda Takashi、Van Damme Daniel、Zhou Yihua、Persson Staffan
    • Journal Title

      Mol. Plant

      Volume: 11 Pages: 346~349

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.11.012

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome2017

    • Author(s)
      Bowman John L. et al., ...Ueda Takashi (113人中104番目)...
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 171 Pages: 287~304.e15

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2017.09.030

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The GYF domain protein PSIG1 dampens the induction of cell death during plant-pathogen interactions2017

    • Author(s)
      Matsui Hidenori、Nomura Yuko、Egusa Mayumi、Hamada Takahiro、Hyon Gang-Su、Kaminaka Hironori、Watanabe Yuichiro、Ueda Takashi、Trujillo Marco、Shirasu Ken、Nakagami Hirofumi
    • Journal Title

      PLOS Genet.

      Volume: 13 Pages: e1007037

    • DOI

      https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007037

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Triphosphate Tunnel Metalloenzyme Function in Senescence Highlights a Biological Diversification of This Protein Superfamily2017

    • Author(s)
      Ung Huoi、Karia Purva、Ebine Kazuo、Ueda Takashi、Yoshioka Keiko、Moeder Wolfgang
    • Journal Title

      Plant Phys.

      Volume: 175 Pages: 473~485

    • DOI

      https://doi.org/10.1104/pp.17.00700

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Constitutive activation of plant-specific RAB5 GTPase confers increased resistance against adapted powdery mildew fungus2017

    • Author(s)
      Inada Noriko, Ebine Kazuo, Ito Emi, Nakano Akihiko. and Ueda Takashi
    • Journal Title

      Plant Biothech.

      Volume: 34 Pages: 89-95

    • DOI

      https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.17.0501a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The trans-Golgi Network and the Golgi Stacks Behave Independently During Regeneration After Brefeldin A Treatment in Tobacco BY-2 Cells2017

    • Author(s)
      Ito Yoko、Toyooka Kiminori、Fujimoto Masaru、Ueda Takashi、Uemura Tomohiro、Nakano Akihiko
    • Journal Title

      Plant Cell Phys.

      Volume: 58 Pages: 811~821

    • DOI

      https://doi.org/10.1093/pcp/pcx028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic reorganization of the endomembrane system during spermatogenesis in Marchantia polymorpha2017

    • Author(s)
      Minamino Naoki、Kanazawa Takehiko、Nishihama Ryuichi、Yamato Katsuyuki T.、Ishizaki Kimitsune、Kohchi Takayuki、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      J. Plant Res.

      Volume: 130 Pages: 433~441

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/s10265-017-0909-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exocytic trafficking pathways in plants: why and how they are redirected2017

    • Author(s)
      Kanazawa Takehiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      New Phytol.

      Volume: 215 Pages: 952~957

    • DOI

      https://doi.org/10.1111/nph.14613

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Diversification of membrane trafficking pathways during land plant evolution unraveled with Marchantia polymorpha2017

    • Author(s)
      Takashi Ueda
    • Organizer
      The 65th NIBB conference Renaissance of Marchantia polymorpha -the genome and beyond-
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Evolution of plant membrane trafficking system driven by diversification of RAB and SNARE protreins2017

    • Author(s)
      Takashi Ueda
    • Organizer
      4th AoE Symposium on Organelle Biogenesis and Function
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Diversification of membrane trafficking pathways during land plant evolution2017

    • Author(s)
      Takashi Ueda
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2017
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Diversification of membrane trafficking pathways during land plant evolution2017

    • Author(s)
      Takashi Ueda
    • Organizer
      SEB Gothenburg 201
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2018-12-17  

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