2021 Fiscal Year Annual Research Report
Age estimation of wild bird by DNA methylation
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17K19426
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
村山 美穂 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60293552)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伊藤 英之 京都市動物園, 生き物・学び・研究センター, 研究教育係長(獣医師) (10779648)
大沼 学 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 主任研究員 (50442695)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2022-03-31
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| Keywords | メチル化 / 野生動物 / 鳥類 / 年齢 / DNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
鳥類などの寿命の長い種については、例えば保全に必要な遺伝的多様性が、どの年齢集団、どの世代の個体間のものなのかは、大変重要であり、DNAによる年齢推定が実現できれば、野外での生態学的研究に画期的な進歩をもたらすことが期待できる。本研究では、鳥類において、哺乳類で報告された年齢に伴うメチル化変動の指標となる候補遺伝子の相同領域を調べ、メチル化と年齢の関連を解明する。さらに、野外調査に役立てるため、羽根などから抽出した微量DNAでも関連が見られるかを調べる。鳥類でも哺乳類と同じく関連性が見つかれば、野外での生態研究に大いに役立つ。メチル化には個体差があることが知られており、年齢推定の誤差の原因になる可能性がある。また哺乳類と鳥類で異なる傾向を示す場合には、進化的な意義を考察することができる。種間や個体間での比較により、そうしたメチル化の機能に関わる基礎情報も期待できる。
本年度は、2種のネコ科動物（イエネコとユキヒョウ）の血液由来のDNAから年齢推定モデルを開発した。イエネコでは健康個体と、慢性腎不全の罹患個体の比較も行った。イエネコの年齢は、平均絶対偏差（MAD）3.83歳で推定された。性別と健康状態は推定精度に影響しており、MADの性別および健康の影響は、イエネコの健康メス2.93歳、健康オス4.63歳、腎不全メス3.76歳、腎不全オス5.08歳であった。ユキヒョウは2.10歳であった。これらの領域の塩基配列は、ネコ科動物の種間で高い相同性を示し、種間の汎用性が高いこと、正確な年齢推定モデルは種、性別、健康状態ごとに調整する必要があることが示唆された。またアジアゾウでも年齢に創刊する領域を見出した。鳥類では、ヤンバルクイナのゲノムをバイサルフェイト処理して次世代シーケンサーで配列を解析し、年齢に伴ってメチル化が変化した領域の探索を開始した。
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