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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Development of reverse optogenetics and its application for analysis of a neural network related to C. elegans locomotion

Research Project

Project/Area Number 17K19452
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

青木 航  京都大学, 農学研究科, 助教 (10722184)

Project Period (FY) 2017-06-30 – 2019-03-31
KeywordsC. elegans / functional cellomics / optogenetics / reverse optogenetics
Outline of Annual Research Achievements

線虫Caenorhabditis elegansは最もシンプルな神経ネットワークを持つモデル生物であり、302個のニューロンと約7000個のニューロン間結合を持っているが、その機能はいまだよくわかっていない。そこで我々は、各ニューロンが行動に与える機能を網羅的にアノテーションするための新規方法論―機能的セロミクス―を開発してきた。具体的には、Cre/loxシステムとオプトジェネティクスを応用し、ひとつひとつのニューロンに対して光作動性チャネルであるオプシンを確率的に標識できる技術を開発した。この技術を用いて、ランダムなパターンでオプシンが標識された線虫ライブラリを構築し、そのライブラリに対して光照射下で行動実験を行い、特徴的な行動を見せた線虫を単離し、その線虫のオプシン標識パターンを調べることで、ニューロンの機能を1細胞レベルで仮説フリーにアノテーションすることができる。我々は、この方法論を線虫の産卵行動に適用し、ひとつのニューロンの活性化が産卵行動の十分条件であることを示した(Scientific Reports, 8, 10380, 2018)。さらに、線虫のロコモーションを制御する神経ネットワークの動作モデルを構築するために、本システムの適用を試みた。具体的には、線虫ライブラリのロコモーションをトラッキングしつつ解析するシステムを構築し、機能的セロミクス解析を行い、ロコモーションモチーフと神経ネットワークの関係の解析を進めている。機能的セロミクスをさまざまな行動系に適用することで、普遍的な脳の計算メカニズムを理解できるようになる期待される。

  • Research Products

    (10 results)

All 2019 2018

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 4 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Cellomics approach for high-throughput functional annotation of Caenorhabditis elegans neural network2018

    • Author(s)
      Aoki Wataru、Matsukura Hidenori、Yamauchi Yuji、Yokoyama Haruki、Hasegawa Koichi、Shinya Ryoji、Ueda Mitsuyoshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1038/s41598-018-28653-x

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 神経ネットワーク機能の網羅的解析を目指した バイアスフリーオプトジェネティクスの開発2018

    • Author(s)
      青木 航
    • Organizer
      細胞凝集研究会
    • Invited
  • [Presentation] ファンクショナルセロミクスによる神経ネットワークのハイスループットアノテーション2018

    • Author(s)
      山内悠至,松倉秀典,青木航,植田充美
    • Organizer
      生物工学会
  • [Presentation] Cellomics approach for high-throughput functional annotation of Caenorhabditis elegans neural network2018

    • Author(s)
      Wataru Aoki
    • Organizer
      Max Planck Florida Institute-JST(PRESTO) Joint Workshop on Neuroscience and Single Cell Research
    • Invited
  • [Presentation] 機能的セロミクスを用いた線虫行動の解析2018

    • Author(s)
      松倉 秀典, 山内 悠至, 横山 治樹, 青木 航, 植田 充美
    • Organizer
      分子生物学会
  • [Presentation] 線虫神経ネットワークのハイスループットアノテーション法の開発2018

    • Author(s)
      山内悠至,松倉秀典,横山治樹,青木 航,植田充美
    • Organizer
      分子生物学会
  • [Presentation] 仮説フリーサイエンスの拡張による生命理解の高速化2018

    • Author(s)
      青木 航
    • Organizer
      第3回生物機能開発研究所講演会
    • Invited
  • [Presentation] Cellomics approach for high-throughput functional annotation of Caenorhabditis elegans neural network2018

    • Author(s)
      Wataru Aoki
    • Organizer
      12th International workshop on approaches to single cell analysis
    • Invited
  • [Book] バイオイノベーションに向けて~バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点~2019

    • Author(s)
      青木 航
    • Total Pages
      258
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      978-4-7813-1411-2
  • [Book] AI導入によるバイオテクノロジーの発展2018

    • Author(s)
      青木 航
    • Total Pages
      234
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      978-4-7813-1315-3

URL: 

Published: 2019-12-27  

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