2018 Fiscal Year Research-status Report
非遺伝母組織適合性抗原(NIMA)免疫寛容と妊娠高血圧腎症発症に関する探索的研究
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17K19880
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Research Institution | Tohoku University |
Principal Investigator |
菅原 準一 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (60280880)
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Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2020-03-31
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Keywords | 妊娠高血圧症候群 / 妊娠高血圧腎症 / ゲノムワイド関連解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
三世代コホート参加者を対象として、データクリーニングはほぼ終了し、妊娠高血圧腎症:PE罹患妊婦、夫、児、妊婦祖父母各20例、計100例(20家系)、および対照群:正常妊娠による妊婦、夫、児、妊婦祖父母各20例、計100例(20家系)、合計40家系200例の抽出作業を行った。PE罹患妊婦、夫、児(臍帯血)、母方祖父母の末梢血からDNAを抽出、ジャポニカアレイによるSNPスキャンを開始した。また、長鎖型シークエンサーを使用するためのプライマー作成を進め、シークエンスを開始した。現在情報解析における至適条件の検討を進めている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
三世代コホートにおける家系情報の検証や調査票データのクリーニングに予想以上に時間がかかったため、ゲノム解析の開始がやや遅れている。
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Strategy for Future Research Activity |
SNPアレイ解析はおおむね順調に進むと推測されるが、長鎖型シークエンサーによる至適解析条件の検討を主体に進める。
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Causes of Carryover |
進捗状況においても述べたように、大規模三世代コホートデータの家系情報の検証とデータクリーニングに、当初計画以上に時間がかかったため。SNPアレイ解析を進め、HLAタイピング作業を加速させる。
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