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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Genome-wide analysis of regulation of miRNA processing and its effects on transcriptome

Research Project

Project/Area Number 17K20145
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

岡村 勝友  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (70817733)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
KeywordsmicroRNA / 遺伝子発現制御 / RNA結合蛋白質
Outline of Annual Research Achievements

microRNA(miRNA)は遺伝子発現を制御する重要な小分子RNA群である。miRNAは標的遺伝子の発現を制御する因子である一方で、その発現量も厳密に制御される必要がある。本研究では疾患組織やモデル動物の大規模RNA発現データの数理的解析を通して、小分子RNA発現を制御する機構の候補を絞り込んだ。その候補因子について培養細胞を用いた検証実験を行うことで小分子RNA生合成における役割を探索した。その中でmiRNA生合成中間産物に結合して生合成制御を行うと考えられるRNA結合蛋白質なども同定され、新規のmiRNA生合成調節機構を見出した。これらの分子機構をより詳細に解明するため、簡便に蛍光タンパク質タグを内在性遺伝子座に挿入することでタンパク質の挙動を生細胞内で解析するためのツールも作出した。このような技術はmiRNA生合成が制御される仕組みの解明を含め、多くの分野の研究の推進に貢献できると期待している。またmiRNA生合成の生化学解析のツールとして、遺伝子特異的なmiRNA生合成阻害剤の開発にも携わり、その効果を実証することができた。さらに、疾患モデル動物や血液サンプルにおけるmiRNA発現解析を行うことで、miRNA発現異常の遺伝子発現制御に対する影響やmiRNA発現異常が疾患に繋がる仕組みの一端を明らかにした。これらの研究から、小分子RNA生合成と他のRNAプロセッシング機構と協調的に制御される機構が見出され、その破綻と疾患の関連の理解に繋がると期待される。

  • Research Products

    (10 results)

All 2021 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Temasek Life Sciences Laboratory/National University of Singapore/National Neuroscience Institute(シンガポール)

    • Country Name
      SINGAPORE
    • Counterpart Institution
      Temasek Life Sciences Laboratory/National University of Singapore/National Neuroscience Institute
  • [Int'l Joint Research] King's College London(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      King's College London
  • [Int'l Joint Research] Memorial Sloan-Kettering Cancer Center(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
  • [Journal Article] RNA-dependent RNA polymerases in the black-legged tick produce Argonaute-dependent small RNAs and regulate genes2021

    • Author(s)
      Feng, Canran; Torimaru, Kyosuke; Lim, Mandy Yu Theng; Chak, Li-Ling; Tsuji, Kosuke; Tanaka, Tetsuya; Iida, Junko; Okamura, Katsutomo
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2021.09.19.460923

    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] microRNA-150-5p: A Novel Blood-Based Biomarker for Alzheimer’s Dementia with Good Correlation to Cognition, Cerebrospinal Fluid Amyloid-β, and Cerebral Atrophy2021

    • Author(s)
      Sook-Yoong Chia Ashwati Vipin Kok-Pin Ng Haitao Tu Ananth Bommakanti Brian Zhiyang Wang Yi Jayne Tan Fatin Zahra Zailan Adeline Su-Lyn Ng Shuo-Chian Ling3 Katsutomo Okamura Eng-King Tan Nagaendran Kandiah Li Zeng
    • Journal Title

      Research Square

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-942370/v1

    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel tick RdRP-dependent small RNA pathways have roles in gene regulation2021

    • Author(s)
      Canran Feng Mandy Yu Theng Lim Li-Ling Chak Junko Iida Katsutomo Okamura
    • Organizer
      RNA meeting 2021 in Tsuruoka
  • [Presentation] Improvement of intronic knock-in system by using NHEJ (non-homologous end joining) for in vivo characterization of RNA-binding proteins2021

    • Author(s)
      Yuma Hanai Yae Toda Katsutomo Okamura
    • Organizer
      RNA meeting 2021 in Tsuruoka
  • [Presentation] Global prediction of regulators of miRNA processing using cancer cell line gene expression data.2021

    • Author(s)
      Ryosuke Hirota Junko Iida Katsutomo Okamura
    • Organizer
      RNA society meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Argonauteによる成熟miRNA産生の選択的促進の生物学的役割2021

    • Author(s)
      Yun Sungsik, Lee Li Ming , 島本 廉, Wan Yun Ho, Shuo-Chien Ling, Eugene V. Makeyev, 岡村 勝友
    • Organizer
      日本分子生物学会
  • [Presentation] miRNA生合成の制御2021

    • Author(s)
      岡村 勝友
    • Organizer
      東名産学官・医連携研究会
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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