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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Development of a taxis model of cells: application for medicine and evolutionary biology

Research Project

Project/Area Number 17KK0080
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

石川 拓司  東北大学, 医工学研究科, 教授 (20313728)

Project Period (FY) 2018 – 2021
Keywordsバイオテクノロジー / 微生物 / モデル化
Outline of Annual Research Achievements

今年度はコロナ禍の影響でイギリスのケンブリッジ大学を訪問することはできなかったが、オンラインでの研究打合せを密に行うことで、共同研究を推進した。
まず始めに、微生物の協調遊泳の不安定性を応用数学的に解析し、不安定現象の数理を解明した。その結果を数値シミュレーションによって確かめ、遊泳モードの違いによる不安定性の強さを定量的に明らかにした。この成果は、理論物理の分野で定評のあるEurophysics Letters誌に掲載された(Lauga, Ishikawa, et al., Europhysics Letters, 2021)。また、さまざまな遊泳モードを持つ微生物の2体干渉の解析を行い、干渉運動の相図を作成した。これにより、微生物干渉の体系的な理解が進んだ。この成果は、流体力学で定評のあるPhys. Rev. Fluids誌に掲載された(Darveniza, Pedley, Ishikawa et al., Phys. Rev. Fluids,2022)。この研究をさらに発展させ、多数の微生物が作り出すプルームの安定解析も行った。この成果は、査読付き雑誌論文として現在準備中である。この他にも、多細胞動物の起源となる襟べん毛虫の群体の遊泳・摂食解析を行い、細胞走性モデルを進化生物学へと展開した。
Lauga 教授には、数値解析手法についても数理的なアドバイスをいただいた。この議論に触発され、申請者は境界要素法と潤滑理論を組み合わせたLT-BEM 法を開発した(Ishikawa, J. Comp. Phys., 2022)。
これらの共同研究を通じて、当初の予定通り、ケンブリッジ大学DAMTPの3名の教授(Goldstein教授、Pedley教授、Lauga教授)の全員と、無事に国際共著論文を執筆することができた。

  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ケンブリッジ大学(英国)2019

    • Year and Date
      2019-04-15 – 2019-09-07 | 2019-09-142019-09-30 | 2020-08-012020-08-20
    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      ケンブリッジ大学
    • Co-investigator Overseas
      R. E. Goldstein教授
    • Department
      応用数学・理論物理学科
    • Job Title
      Professor
  • [Journal Article] Pairwise scattering and bound states of spherical microorganisms2022

    • Author(s)
      Darveniza C.、Ishikawa T.、Pedley T. J.、Brumley D. R.
    • Journal Title

      Physical Review Fluids

      Volume: 7 Pages: 013104

    • DOI

      10.1103/PhysRevFluids.7.013104

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Lubrication theory and boundary element hybrid method for calculating hydrodynamic forces between particles in near contact2022

    • Author(s)
      Ishikawa Takuji
    • Journal Title

      Journal of Computational Physics

      Volume: 452 Pages: 110913

    • DOI

      10.1016/j.jcp.2021.110913

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Zigzag instability of biased pusher swimmers2021

    • Author(s)
      Lauga Eric、Nghi Dang Thanh、Ishikawa Takuji
    • Journal Title

      Europhysics Letters

      Volume: 133 Pages: 44002

    • DOI

      10.1209/0295-5075/133/44002

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Hydrodynamics of ciliary swimming2021

    • Author(s)
      Takuji Ishikawa
    • Organizer
      Biofluid Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RHEOLOGY OF A CONCENTRATED MONOLAYER OF SPHERICAL SQUIRMERS2021

    • Author(s)
      T. J. Pedley, Takuji Ishikawa, D. R. Brumley
    • Organizer
      ICTAM 2020+1 conference
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] Biological Flow Studies Laboratory

    • URL

      http://www.bfsl.mech.tohoku.ac.jp/index_jp.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

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