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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Chromoatin organization and transcription regulation during zebrafish zygotic genome activation

Research Project

Project/Area Number 17KK0143
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

佐藤 優子  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 助教 (70435882)

Project Period (FY) 2018 – 2020
Keywordsクロマチン / エピジェネティクス / ゼブラフィッシュ / 胚ゲノム活性化 / ライブイメージング
Outline of Annual Research Achievements

本研究ではこれまで、ゼブラフィッシュ初期胚発生過程におこる胚ゲノム活性化におけるmiR-430遺伝子クラスター発現機構について、蛍光プローブを用いたライブイメージングによる解析を行ってきた。令和2年度は、転写制御機構のより詳細な解析を行うため、(1) リン酸化型RNAポリメラーゼIIの可視化系の改良の検討と(2) 転写開始型RNAポリメラーゼ集積へのヒストンアセチル化依存の解析を行った。

(1) 転写開始型(Ser5リン酸化型)および転写伸長型(Ser2リン酸化型)RNAポリメラーゼIIに対する特異的抗体から可変領域をコードする遺伝子をクローニングし、1本差可変領域として蛍光タンパク質融合型として細胞内に発現させる蛍光プローブmintbodyを作製した。これらのmintbodyプローブのmRNAをin vitro合成し、ゼブラフィッシュ受精卵へのマイクロインジェクションを行った。mintbodyプローブの発現を確認するため、共焦点顕微鏡を用いて4細胞期以降の発生過程におけるmiR-430遺伝子クラスターの転写活性化状態の観察を行ったところ、4細胞期から1000細胞期まではいずれのプローブも発現レベルが低く、リン酸化状態の検出が困難であることが分かった。

(2) ヒストンのアセチル化が転写活性化のどの段階に重要であるか調べるため、アセチル化ヒストン結合タンパク質BETファミリーに対する阻害剤JQ-1を添加した胚における、転写開始型RNAポリメラーゼIIのmiR-430遺伝子クラスターへの集積の観察を行った。蛍光標識Fabプローブを用いてSer5リン酸化型RNAポリメラーゼII動態を調べた結果、JQ-1添加によりmiR-430遺伝子への集積が抑制されることが分かった。

  • Research Products

    (5 results)

All 2021 2020 2018

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 3 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ニューヨーク大学(アメリカ合衆国)2018

    • Year and Date
      2018-08-01 – 2018-12-20 | 2019-08-012019-12-20
    • Country Name
      アメリカ合衆国
    • Counterpart Institution
      ニューヨーク大学
    • Co-investigator Overseas
      Timothee Lionnet博士
    • Department
      Institute for Systems Genetics
    • Job Title
      Assistant Professor
  • [Journal Article] Transcription organizes euchromatin via microphase separation2021

    • Author(s)
      Hilbert Lennart、Sato Yuko、Kuznetsova Ksenia、Bianucci Tommaso、Kimura Hiroshi、J?licher Frank、Honigmann Alf、Zaburdaev Vasily、Vastenhouw Nadine L.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 1360

    • DOI

      10.1038/s41467-021-21589-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing2021

    • Author(s)
      Tjalsma Sjoerd J D、Hori Mayako、Sato Yuko、Bousard Aurelie、Ohi Akito、Raposo Ana Cl?udia、Roensch Julia、Le Saux Agnes、Nogami Jumpei、Maehara Kazumitsu、Kujirai Tomoya、Handa Tetsuya、Bag?s‐Arnal Sandra、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi、da Rocha Simao Teixeira、Zylicz Jan J、Kimura Hiroshi、Heard Edith
    • Journal Title

      EMBO reports

      Volume: 22 Pages: e51989

    • DOI

      10.15252/embr.202051989

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Visualizing transcription sites in living cells using a genetically encoded probe specific for the elongating form of RNA polymerase II2021

    • Author(s)
      Uchino Satoshi、Ito Yuma、Sato Yuko、Handa Tetsuya、Ohkawa Yasuyuki、Yokunaga Makio、Kimura Hiroshi
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: 441582

    • DOI

      10.1101/2021.04.27.441582

    • Open Access
  • [Presentation] Spatiotemporal dynamics of histone modifications during zebrafish zygotic genome activation2020

    • Author(s)
      佐藤優子、Nguyen Thi Bich Ngoc、小田春佳、半田哲也、西原秀典、原田哲仁、大川恭行、木村宏
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited

URL: 

Published: 2021-12-27  

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